揭秘杨树应对低氮胁迫的 “幕后帮手”：miR168a和 U6 snRNA 的关键作用

研究人员评估 14 个 miRNAs 作杨树低氮胁迫下根参考基因的适用性，发现 miR168a和 U6 snRNA 最稳定，意义重大。

　　微小 RNA（miRNAs）是一类具有调控作用的 RNA 分子，在揭示植物如何适应低氮胁迫方面发挥着关键作用。研究 miRNA 的表达水平，有助于深入了解植物对氮缺乏的响应机制。实时定量 PCR（RT-qPCR）常用于分析特定条件下 miRNA 的表达情况，而选择合适的内参基因对确保实验结果的可靠性至关重要。然而，在低氮胁迫下，适用于杨树根部 miRNA 表达研究的内参基因尚未明确。

本研究评估了 14 个 miRNAs 作为低氮胁迫下杨树根部内参基因的适用性，综合考量了它们的扩增效率和稳定性，并运用 geNorm、NormFinder、deltaCt 和 BestKeeper 等方法进行分析。结果显示，在实验条件下，miR168^a和 U6 小核 RNA（U6 snRNA）是最稳定的内参基因。此外，研究还利用小 RNA 测序（miRNA-seq）数据对这些 miRNA 的稳定性进行了验证。分析表明，以 miR168^a和 U6 snRNA 作为内参基因时，miR399^a、miR169^c、miR171^a-3p 和 miR166ⁿ的表达谱与 miRNA-seq 数据中的每百万转录本数（TPM）值相符。

这项研究确定了低氮胁迫下杨树根部适用的 miRNA 内参基因，为推动植物应对氮限制的相关研究提供了重要参考。