植物进化历程中，维管化与种子形成对密码子使用模式的影响探秘

研究人员开展植物维管化和种子生产进化与密码子使用模式相关性研究，揭示两者关联及突变压力影响。

　　生物进化过程中，密码子使用模式的变化一直是一个引人深思的问题。本研究探索了植物不同谱系中，维管化（vascularization）和种子产生（seed production）这两个进化事件与密码子使用模式之间的相关性。研究发现，非维管植物谱系的最优密码子通常以 GC 结尾，而维管植物谱系的最优密码子则以 AU 结尾。对应分析（Correspondence analysis ）和基于模型的聚类分析表明，密码子使用模式的进化与维管化这一进化事件的关联，比与种子生产的关联更为紧密。在所有植物谱系中，二核苷酸 CpG 和 TpA 的出现频率较低，而除藻类外，二核苷酸 TpG 的出现频率偏高。进化上相关的谱系表现出相似的密码子对偏好。二核苷酸 CpA 的出现频率与其母密码子对相似。虽然在决定密码子使用偏好方面，自然选择（natural selection ）的作用大于突变压力（mutational pressure ），但在非维管植物谱系中，突变压力的相对影响比维管植物谱系更高。