发现 miR-4443、miR-572 和 miR-150-5p:乳腺癌诊断的潜在新 “利器”

【字体: 时间:2025年03月11日 来源:Biochemical Genetics 2.1

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  为探寻乳腺癌诊断新方法,研究人员筛选 miRNA,发现 miR-4443 等可辅助诊断,意义重大。

  乳腺癌是女性中最常见的浸润性癌症,也是癌症相关死亡的主要原因,每年导致超过 50 万人死亡。本研究旨在通过生物信息学分析确定一组有前景的微小 RNA(miRNA),并在临床环境中对其准确诊断乳腺癌患者的效用进行临床验证。
首先,在研究的计算机分析阶段,利用生物信息学分析和基因表达综合数据库(GEO)中的可用数据,筛选出在肿瘤组织间质液中表达增加的 miRNA(差异表达 miRNA),并选择其相关的靶基因。运用 R 软件的 Multimir 程序包来确定差异表达 miRNA(DEM)的靶基因。使用基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,对发现的基因的生物学功能进行分析。为了确定重要信号通路和细胞功能背后的分子机制,利用 STRING 和 Cytoscape 软件构建蛋白质 - 蛋白质相互作用网络。

随后,在实验室阶段,通过实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)方法,检测了 26 例乳腺癌患者和 26 例对照者的血清样本,以及 14 例肿瘤组织样本和 14 例癌旁正常组织样本中三种候选 miRNA 的表达水平。然后,通过受试者工作特征曲线(ROC)分析评估候选 miRNA 的敏感性和特异性。

计算机分析后发现,与乳腺癌组织相比,miR-4443、miR-572 和 miR-150-5p 这三种 miRNA 在乳腺癌患者的间质液中高度增加。此外,研究结果显示,与正常对照组相比,乳腺癌患者血清中 miR-4443、miR-572 和 miR-150-5p 的表达水平显著降低。而且,与癌旁非肿瘤组织相比,肿瘤组织中 miR-4443 和 miR-150-5p 的表达水平也显著降低。ROC 曲线分析表明,这三种 miRNA 对乳腺癌患者的诊断具有较高的敏感性和特异性。数据分析使用 GraphPad Prism 软件进行。

研究结果表明,测量血清中肿瘤来源的 miRNA,可能是一种重要的乳腺癌血液检测方法。miR-4443、miR-572 和 miR-150-5p 似乎是有前景的、具有高敏感性和特异性的诊断生物标志物。然而,需要注意的是,要在临床实践中明确将这些 miRNA 用作潜在生物标志物,还需要进一步研究。
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