根瘤菌接种剂菌株鉴定新方法:开启精准研究与监测新篇章

【字体: 时间:2025年03月12日 来源:Microbiology 1.3

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  研究人员开展根瘤菌接种剂菌株鉴定方法研究,构建多重 PCR 引物系统,助力相关研究。

  在根瘤菌接种剂的田间研究中,需要运用简单可靠的方法来鉴定所使用的菌株,以确切查明是哪种菌株形成了固氮根瘤。在测试接种剂菌株相对于本地根瘤菌菌株的竞争能力时,会出现这个问题,这是为了追踪接种剂菌株在引入后的长期命运;最后,菌株所有者和开发者可能需要此类方法来维护自身权益。所提出的鉴定方法的核心在于寻找菌株特异性的 DNA 区域(该区域在同一物种的其他基因组中不存在),并构建用于多重聚合酶链式反应(PCR)的引物系统,这能够实现简单、可靠且快速的菌株鉴定。与其他鉴定技术相比,这种方法的优势在于,其一,具有高重复性;其二,该方法基于对结构变异的检测,结构变异对根瘤菌基因组进化的贡献相当大,而大多数基因组指纹技术(如扩增片段长度多态性(AFLP)、随机扩增多态性 DNA(RAPD)、重复序列外显子 PCR(REP)、肠杆菌基因间重复一致序列 PCR(ERIC)等)是基于检测短基因组片段中的核苷酸多态性,却遗漏了许多与基因组重排和水平基因转移相关的事件。所提出的方法还可用于监测根瘤菌接种剂菌株的进化动态,尤其是基因组中的独特片段,这对于豌豆根瘤菌(R. leguminosarum)而言非常重要,因为与其他根瘤菌相比,豌豆根瘤菌中独特序列的比例要高得多。
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