飞鱼线粒体基因组研究:拓展认知,揭示系统发育关系
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时间:2025年03月18日
来源:Journal of Biosciences 2.1
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为探究飞鱼(Exocoetidae)线粒体基因组及系统发育关系,研究组装 7 种飞鱼线粒体基因组,有重要意义。
飞鱼(Exocoetidae)是颌针鱼目(Beloniformes)中高度特化的一类,包含 4 个亚科、7 个属和 78 个物种。然而,目前仅有少数飞鱼物种的线粒体基因组有相关描述。鉴于线粒体基因组(mitogenomes)在进化研究中的重要性,本研究旨在拓展对飞鱼线粒体基因组的认知,并探究其系统发育关系。研究人员利用公开的 DNA 测序(DNA-Seq)文库,成功组装出 7 种飞鱼的线粒体基因组。研究发现,飞鱼的线粒体基因组在所有物种中呈现出保守的特征,都含有 22 个转运核糖核酸(tRNAs)、2 个核糖体核糖核酸(rRNAs)和 13 个蛋白质编码基因,这些是脊椎动物共有的特征。唇飞鱼属(Cheilopogon)被重构为多系群,包含 4 个进化枝,这进一步证实了之前关于唇飞鱼属并非单系群的研究结论。同时,研究还发现所有 4 个亚科均为单系群,其中拟飞鱼亚科(Parexocoetinae)是其他所有亚科的姊妹群。飞鱼物种间的遗传距离比下鱵属(Hyporhamphus)物种间的遗传距离小两倍,这表明飞鱼科的遗传分化程度较低。本研究拓展了对飞鱼线粒体基因组特征的认知,提供了目前为止用于研究飞鱼的最全面的线粒体基因组数据集之一。该研究借助公开数据得以完成,这也凸显了在线粒体基因组学(mitogenomics)和系统发育学(phylogenetics)领域重复利用此类数据的重要性。
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