重大发现!NF-κB 相关的 4 个基因或成银屑病诊疗新 “钥匙”
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时间:2025年03月23日
来源:Archives of Dermatological Research 1.8
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研究人员为改善银屑病诊疗,筛选 NF-κB 相关基因,发现 4 个潜在生物标志物,意义重大。
银屑病是一种常见的慢性复发性炎症性皮肤病,需要确定新的潜在生物标志物来改进其诊断和治疗。核因子 κB(NF-κB)信号通路失调是慢性炎症性疾病的一个标志。因此,本研究旨在确定与 NF-κB 相关的生物标志物,用于银屑病的诊断和治疗。从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus)下载银屑病相关数据集,以筛选差异表达基因(DEGs)。将 DEGs 与 NF-κB 相关基因取交集,得到 NF-κB_DEGs。为 NF-κB_DEGs 构建蛋白质 - 蛋白质相互作用网络,并使用 MCODE 插件识别枢纽基因。通过套索回归(LASSO),确定了与 NF-κB 相关的银屑病特征基因,并开发了一个诊断模型。使用 GSE13355 和 GSE30999 数据集对该模型进行验证。通过单样本基因集富集分析评估对照组和银屑病组之间免疫细胞浸润的差异。最后,对特征基因的功能相似基因、相关通路、转录因子(TFs)、微小 RNA(miRNAs)和潜在治疗药物进行预测。研究发现了 4 个与 NF-κB 相关的基因 ——LYN、MALT1、MYD88 和 PTGS2,它们对银屑病具有重要的诊断价值。利用这些基因构建的诊断模型在训练集和验证集中均表现出高可靠性和有效性。免疫分析显示,银屑病组和对照组之间存在显著差异,银屑病样本中树突状细胞(DCs)、巨噬细胞、B 细胞和 T 细胞大量富集。还确定了 20 个与特征基因功能相关的基因,这些基因主要参与 IκB 激酶 / NF-κB 信号通路和 Toll 样受体信号通路等。此外,预测了 70 个与这些基因相关的 TFs(包括 SP1、FOS 和 JUN)和 17 个 miRNAs(包括 hsa-let-7b、hsa-miR-30a 和 hsa-miR-155)。在潜在的治疗候选药物中,槲皮素在综合评估中得分最高,表现最为突出。本研究确定的 4 个潜在生物标志物 LYN、MALT1、MYD88 和 PTGS2,对银屑病的诊断和治疗具有重要价值。
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