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为探究急性胃肠炎的病因,来自中国深圳的研究人员开展人类腺病毒(HAdV)和札如病毒(SaV)共感染的研究。他们对 873 份腹泻粪便样本检测分析,发现两例共感染样本,且病毒具有特定的遗传特征。该研究为追踪疫情奠定基础。
近年来,多种腹泻病毒的共感染已逐渐被视为急性胃肠炎的重要病因。了解这些病毒的遗传多样性和进化关系,对于有效识别和追踪疫情至关重要。本研究旨在报告两例人类腺病毒(HAdV)和札如病毒(SaV)的共感染病例,并通过全基因组测序(WGS)和系统发育分析来阐明这些病毒的遗传多样性和进化模式。
研究人员于 2021 年在中国深圳的哨点医院收集了共计 873 份腹泻粪便样本。采用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)对收集的粪便样本进行鉴定,阳性样本在 NovaSeq 平台上进行全基因组测序。使用 MEGA 软件构建系统发育树,以分析病毒的遗传关系。
测序结果显示,两份样本均为 41 型人类腺病毒,它们分别聚集在两个不同的进化分支中。此外,研究人员还从同一样本中获得了札如病毒(GI.1 基因型)的完整基因组。系统发育分析表明,这些病毒与先前报道的毒株相似,属于在中国占优势的进化分支。
本研究揭示了人类腺病毒和札如病毒共感染流行毒株的遗传多样性,为急性胃肠炎疫情的识别和追踪奠定了基础。