从韩国海洋泥中分离出的产类胡萝卜素新菌株：玫红类芽孢杆菌（Paenibacillus roseopurpureus sp. nov.）及其研究意义

为明确韩国海洋泥中细菌种类，来自韩国的研究人员对菌株 MBLB1832T展开研究。结果发现该菌株为革兰氏阳性、产芽孢的杆状菌，其基因组含完整 C30类胡萝卜素合成途径。这为微生物分类及类胡萝卜素合成研究提供了新依据。

　　从韩国蔚珍的海洋泥中分离出一种新的细菌菌株，命名为 MBLB1832^T。该菌株革兰氏染色呈阳性，能形成内生孢子，呈杆状形态。它在 10 至 45°C（最适温度 30°C）、pH 6.0 - 9.0（最适 pH 7.0）以及 0 - 2% NaCl（最适 0%）的条件下生长。基于 16S rRNA 基因序列的系统发育分析表明，MBLB1832^T菌株与Paenibacillus allorhizoplanae JJ-42^T密切相关，相似度达 98.3% 。其主要脂肪酸为 anteiso-C_15:0和 iso-C_16:0，主要类异戊二烯醌为甲基萘醌 - 7（menaquinone-7）。MBLB1832^T菌株的细胞壁肽聚糖中含有内消旋二氨基庚二酸（meso-diaminopimelic acid）。极性脂质分析显示，其主要脂质包括双磷脂酰甘油（diphosphatidylglycerol）、磷脂酰甘油（phosphatidylglycerol）和磷脂酰乙醇胺（phosphatidylethanolamine） 。MBLB1832^T菌株的基因组大小为 5.8 Mb，G + C 含量为 46.9%。平均核苷酸同一性（Average nucleotide identity）、平均氨基酸同一性（Average amino acid identity）和 DNA - DNA 杂交值证实该菌株与先前描述的物种不同。基因组分析揭示其存在完整的 C₃₀类胡萝卜素生物合成途径，包括编码法尼基二磷酸合酶（farnesyl diphosphate synthase）、八氢番茄红素合酶（diapophytoene synthase）、几种八氢番茄红素去饱和酶（diapophytoene desaturases）以及独特的类胡萝卜素糖基转移酶（carotenoid glycosyltransferases）和酰基转移酶（acyltransferases）的基因。值得注意的是，该菌株产生的类胡萝卜素色素使细胞沉淀呈现粉红色。基于这些多相分类学数据，MBLB1832^T菌株被提议作为类芽孢杆菌属（Paenibacillus）的一个新物种，命名为玫红类芽孢杆菌（Paenibacillus roseopurpureus sp. nov.），模式菌株为 MBLB1832^T = KCTC 43262^T = JCM 34221^T。