编辑推荐:
为探究头足类动物副缠卵腺(ANG)微生物群动态,研究人员以大鳍礁鱿为模型,开展微生物群落相关研究。结果发现 ANG 微生物群存在物种特异性差异,且色素区域微生物多样性较低。该研究有助于理解宿主 - 微生物相互作用机制,为头足类养殖提供理论支持。
在神秘的海洋世界里,头足类动物一直吸引着科学家们的目光。其中,某些头足类动物的特殊器官中存在着大量微生物,比如光器官和副缠卵腺(ANG)。光器官内微生物与宿主的相互作用已被深入研究,然而 ANG 内微生物的奥秘却还未被完全揭开。在头足类动物的繁殖过程中,ANG 起着至关重要的作用,其内部的微生物群不仅影响着胚胎的生存,还与雌性的生殖周期密切相关。但目前,对于 ANG 在雌性成熟过程中细菌选择和维持机制的全面研究仍十分匮乏,这就如同在黑暗中摸索,迫切需要一道光来照亮前行的道路。
为了深入了解 ANG 微生物群的秘密,来自台湾的研究人员踏上了探索之旅。他们以大鳍礁鱿(Sepioteuthis lessoniana)为研究模型,因为相较于其他头足类动物,大鳍礁鱿的 ANG 尺寸较大,更便于研究。研究人员开展了一系列研究,旨在揭示 ANG 特定区域的微生物群落特征,以及色素区域相关微生物对大鳍礁鱿生殖适应性的影响。
研究人员通过 16S rRNA 基因群落分析等技术,对不同头足类动物的 ANG 微生物群进行了全面研究。结果显示,不同头足类动物 ANG 的微生物群落结构存在显著差异,大鳍礁鱿的 ANG 拥有更为丰富的细菌群落。在大鳍礁鱿的 ANG 中,还发现了与不同色素区域相关的特定微生物群。例如,橙色区域富含 Hyphomicrobiaceae(α - 变形菌纲),白色区域则有独特的 Fodinicurvataceae(α - 变形菌纲)和 Flavobacteriaceae(拟杆菌纲)。此外,研究还发现 ANG 色素区域的微生物多样性低于整个 ANG 组织,且不同色素区域的免疫反应相关基因转录水平存在差异,橙色区域的部分免疫反应相关基因转录水平较高。
这项研究成果发表在《Animal Microbiome》上,具有重要意义。它不仅揭示了 ANG 微生物群的物种特异性和颜色相关模式,为理解头足类动物与微生物的共生关系提供了新的视角,还可能为大鳍礁鱿的人工养殖提供理论支持,有助于解决当前养殖过程中面临的一些问题,如提高孵化率等。
研究人员在研究过程中,主要运用了以下关键技术方法:首先,从台湾基隆和平岛附近海域采集了包括大鳍礁鱿在内的多种头足类动物样本;然后,通过基因分型技术(如细胞色素氧化酶 c 亚基 I,COI,序列分析)准确鉴定物种;接着,利用核酸提取技术获取 ANG 样本的总 DNA 和总 RNA;最后,运用 PCR 扩增、文库制备和扩增子测序技术,以及定量实时 PCR(qPCR)技术来分析微生物群落结构和基因表达水平。
下面详细介绍研究结果:
- 三种头足类动物 ANG 的细菌群落组成:研究人员从三种头足类动物的 17 个 ANG 样本中获得了 2490 个扩增子序列变体(ASVs)。分析发现,大鳍礁鱿 ANG 的微生物多样性高于其他两种动物。不同头足类动物 ANG 的细菌群落组成在类水平上存在差异,Alphaproteobacteria 和 Bacteroidia 在所有 ANG 样本中都存在,而 Gammaproteobacteria 在剑尖枪乌贼和大鳍礁鱿中大量存在,Acidimicrobiia 仅与剑尖枪乌贼相关,Holophagae 和 Verrucomicrobiae 主要与大鳍礁鱿相关。主坐标分析(PCoA)显示,ANG 的微生物群落结构因物种而异。
- 成熟雌性大鳍礁鱿 ANG 的特征:成熟雌性大鳍礁鱿 ANG 的背侧有许多小的色素区域,腹侧则有几个大的色素区域。组织学分析表明,ANG 有两层结构,内层次级小管中有四种上皮细胞类型。这些发现表明,每个次级小管簇可通过颜色区分。
- 大鳍礁鱿 ANG 色素区域的细菌群落组成:研究人员对大鳍礁鱿 ANG 色素区域和整个 ANG 的微生物群落进行比较分析。结果发现,色素区域的微生物多样性低于整个 ANG 组织。PCoA 显示,橙色区域和整个 ANG 组织的微生物群落结构存在明显差异。在不同色素区域中,Alphaproteobacteria 在色素区域的丰度增加,可能在这种关联中起主要作用。
- 大鳍礁鱿 ANG 中与颜色相关的细菌:在家族水平上分析发现,不同色素区域有独特的细菌家族。Hyphomicrobiaceae 仅存在于橙色微生物群中,Fodinicurvataceae 仅存在于白色微生物群中,Acanthopleuribacteraceae 仅存在于黄色微生物群中。Rhodobacteraceae、Cryomorphaceae 和 Flavobacteriaceae 在三种颜色的微生物群中都有丰富的分布。
- 大鳍礁鱿不同色素区域的基因表达谱:通过 qPCR 分析发现,脂质代谢过程相关基因在不同色素区域的转录水平相似,而部分免疫反应相关基因(如 NOS 和 TGM1)在橙色区域的转录水平高于其他区域。
研究结论和讨论部分进一步强调了这些发现的重要意义。研究表明,Alphaproteobacteria 在头足类动物共生中可能起着关键作用,而 Bacteroidia 的丰度可能与栖息地微生物群的差异有关。ANG 色素区域微生物群落的变化与生殖适应性可能存在关联,特别是 Hyphomicrobiaceae 可能在提高大鳍礁鱿的生殖适应性方面发挥重要作用。此外,ANG 的色素沉着可能是由微生物合成的类胡萝卜素积累导致的,不同微生物可能共同参与了 ANG 的色素形成过程。同时,ANG 上皮细胞形成的屏障表型可能受到微生物群的影响,宿主在色素沉着过程中可能存在潜在的调控机制,免疫相关基因的表达可能有助于维持共生微生物的密度和组成。
总的来说,该研究为头足类动物与微生物的共生关系研究提供了重要的理论依据,为后续进一步探究 ANG 微生物群的功能和调控机制奠定了坚实基础,有望推动头足类动物人工养殖技术的发展。