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为解决高通量测序检测出的低变异等位基因频率(VAF)的 TP53 变异临床分类和管理难题,研究人员开展对疑似遗传性癌症易感性患者 TP53 VAF 评估研究。结果发现 16 例(1%)有 17 个可行动的 TP53 变异,明确低 VAF 变异起源很关键。
高通量测序技术的进步使得 TP53 变异的检测数量增加,其中许多变异以低等位基因分数出现。这些变异可能源于克隆造血(CHIP)或体质嵌合体,这让它们的临床分类和管理变得复杂起来。由于指南建议对携带 TP53 变异的个体采取类似李 - 佛美尼综合征(Li-Fraumeni syndrome,LFS)的管理方式,因此准确判断低变异等位基因分数(VAF)变异的起源,对于风险评估和临床决策来说至关重要。
本研究对疑似遗传性癌症易感性患者的 TP53 VAF 进行评估,这些患者通过多基因 panel 检测。研究强调,在对低 VAF 患者做出临床决策前,进行详细调查十分重要。在回顾性分析的 1520 例病例中,研究人员在 16 例(1%)患者身上发现了 17 个可采取行动的 TP53 变异。所有病例均为女性,平均患癌年龄为 45.9 岁,被归类为 attenuated LFS。其中 11 个变异的等位基因分数≤20%。60 岁以上的患者 VAF 明显低于 40 岁以下的患者(p = 0.03)。TP53 变异仅在一个辅助样本中检测到,且其肿瘤样本为单等位基因,证实了该变异的种系起源。
对于 TP53 变异病例的准确分类和成功管理而言,明确变异的起源,尤其是低 VAF 变异的起源,是势在必行的。