编辑推荐:
胶质瘤(Glioma)是中枢神经系统常见肿瘤,为探究端粒酶逆转录酶(TERT)基因变异与胶质瘤风险关系,研究人员对 317 例患者和 480 例对照进行基因分型研究。发现 8 个 TERT 变异与胶质瘤风险显著相关,其中 rs56345976 可能是关键变异,这为理解胶质瘤发病机制提供新视角。
在人体的微观世界里,肿瘤的发生发展一直是科学家们致力于解开的谜团。胶质瘤作为中枢神经系统(CNS)中最为常见的肿瘤类型,严重威胁着人类健康。过去的研究虽然在胶质瘤的诊疗方面取得了一定进展,但对于其发病的遗传机制,仍有许多未知等待探索。此前,全基因组关联研究(GWAS)已经发现端粒酶逆转录酶(TERT)基因的单核苷酸多态性(SNPs)与胶质瘤风险存在关联,但在韩国人群中的研究尚属空白。为了填补这一空白,深入了解 TERT 基因变异与胶质瘤风险之间的关系,来自韩国多所研究机构(包括 Sogang University、GW Vitek, Inc.、Yonsei University College of Medicine 等)的研究人员展开了此项研究。该研究成果发表在《Scientific Reports》上,为胶质瘤的防治提供了新的理论依据。
研究人员采用了多种关键技术方法。首先,选取了 797 名参与者,包括 317 例胶质瘤患者和 480 例对照,患者样本来自 Yonsei University Severance Hospital 及合作医院,对照样本来自韩国基因组与流行病学研究(KoGES)联盟和韩国国家生物样本库。然后,对候选 TERT SNPs 进行基因分型,利用 Fluidigm EP1 系统进行检测。最后,运用多种软件进行数据分析,如 Haploview v4.2 软件进行连锁不平衡(LD)分析,PHASE 2.1 软件估计单倍型,Logistic 回归分析评估 TERT 变异与胶质瘤风险的关联等。
患者特征
研究人员对 317 例胶质瘤患者和 480 例对照的临床特征进行了详细分析。患者平均年龄 53.43±12.02 岁,男性占 50.7%,依据组织学特征和 2021 年 WHO 中枢神经系统肿瘤分类标准,将患者分为不同亚组。对照组平均年龄 54.8±9.5 岁,男性占 49.4% 。
基因分型 TERT 遗传变异
研究选取的 TERT SNPs 位于染色体 5p15.33,存在三个 LD 块。研究详细记录了各 SNP 的坐标、等位基因、位置等信息,为后续分析奠定基础。
TERT SNPs 与胶质瘤风险的关联
通过 Logistic 回归分析,研究发现 8 个 TERT SNPs(rs2853676、rs2736100、rs10866498、rs7713218、rs4975538、rs2242652、rs10069690 和 rs56345976)与胶质瘤风险显著相关。同时,部分单倍型也与胶质瘤风险存在关联,如 Block2 - ht1 和 block3 - ht3 增加风险,block2 - ht2、block2 - ht3 和 block3 - ht1 降低风险。
TERT 变异对胶质瘤风险的独立性和因果性分析
经过逐步和成对条件分析,rs56345976 在 8 个显著变异中脱颖而出,可能是关键的因果变异。在不同分析模型中,该变异的 A 等位基因对胶质瘤风险存在剂量依赖性影响,且与 WHO 4 级、胶质母细胞瘤(GBM)、异柠檬酸脱氢酶(IDH)野生型和 1p/19q 非共缺失亚组的胶质瘤风险增加相关。此外,通过 eQTL 计算器、Human Splicing Finder 和 FORGE2 - TF 等工具分析发现,rs56345976 的风险等位基因可使基因表达升高,还影响剪接增强子基序和转录因子结合。
研究结论表明,TERT 基因中的特定位点 rs56345976 与胶质瘤风险增加显著相关,且具有因果、独立和剂量依赖性的遗传效应。在不同胶质瘤亚组中,该变异的影响存在差异,尤其在 WHO 4 级、GBM、IDH 野生型和 1p/19q 非共缺失亚组中更为明显。此外,研究还发现 rs56345976 可能通过影响基因表达、剪接增强子基序和转录因子结合,进而影响 TERT 转录效率,与胶质瘤的发生发展相关。虽然该研究存在样本量较小、缺乏全面临床信息等局限性,但为后续研究指明了方向。未来需要进一步开展临床研究,包括 mRNA 和蛋白质分析,以及功能研究,以明确 rs56345976 在韩国人群中对胶质瘤的遗传影响,为胶质瘤的早期诊断、精准治疗和预后评估提供更有力的理论支持 。