解析紫花苜蓿黄花亚种(Medicago sativa ssp. falcata)线粒体基因组:洞察分类学奥秘与种质资源潜力
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时间:2025年04月30日
来源:Planta 3.6
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紫花苜蓿黄花亚种(Medicago sativa ssp. falcata)在抗寒耐旱方面表现优异,是重要基因源。研究人员对其线粒体基因组测序组装并与其他苜蓿物种对比。结果发现基因多态性、RNA 编辑位点等特征,明确其进化地位。该研究助力苜蓿属种质资源挖掘利用。
紫花苜蓿黄花亚种(Medicago sativa ssp. falcata)主要分布于苜蓿生长地理范围的北部,是紫花苜蓿复合体(Medicago sativa complex,也称为 Medicago falacta)的一个亚种。与紫花苜蓿(M. sativa)相比,紫花苜蓿黄花亚种在抗寒和耐旱方面表现更出色,是苜蓿属物种育种改良的优质基因来源。研究人员对紫花苜蓿黄花亚种的线粒体基因组进行了测序和组装,其长度为 307,026 bp,并成功注释了 50 个基因,其中 nad2 基因在四个苜蓿物种中表现出较高的核苷酸多态性。在 24 个蛋白质编码基因中预测出总共 197 个 RNA 编辑位点,这些编辑位点的改变导致大量亮氨酸编码位点的产生,这与密码子使用偏好的结果一致。此外,研究人员对包括蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)在内的四种苜蓿进行了横向比较,发现它们线粒体基因组中的重复序列呈现出一致的分布特征。通过两种方法构建的系统发育树表明,紫花苜蓿黄花亚种在苜蓿属内具有独立的遗传地位,并揭示了其在豆科(Fabaceae family)内的部分亲缘关系。对不同植物中共享蛋白质编码基因的非同义替换率和同义替换率的分析,以及基因转移结果表明,紫花苜蓿黄花亚种的线粒体基因组进化平稳,没有出现剧烈变化的阶段。这项研究为进一步了解紫花苜蓿黄花亚种的遗传背景提供了有用信息,有望为苜蓿属种质资源的基因组挖掘和利用做出贡献。
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