甜菜(Beta vulgaris L.)中 Argonaute 基因家族全基因组鉴定与表达分析:探寻胚胎发育调控密码
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时间:2025年04月30日
来源:Sugar Tech 1.8
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为探究 AGO 蛋白在植物胚胎发育中的作用,研究人员对甜菜全基因组中的 BvAGO 基因家族展开研究。他们鉴定出 9 个成员,分析其特性和表达谱,发现与拟南芥有相似性,部分基因或参与调控胚胎发育,为后续研究提供指引。
Argonaute(AGO)蛋白是植物中由小 RNA 途径介导的靶基因转录诱导沉默复合体的组成部分,它与小 RNA 一起调节基因表达,并影响植物单胚和多胚的形成等过程。在这项研究中,利用 AGO 蛋白的保守结构域对甜菜(Beta vulgaris L.)全基因组中的 BvAGO 基因家族进行了全面系统的鉴定。共鉴定出 9 个 BvAGO 基因家族成员,并通过生物信息学方法对这 9 个家族成员的理化性质、系统发育、基因结构、启动子区域和复制事件进行了分析。此外,研究人员还分析了 AGO 家族 9 个基因在甜菜不同组织中的表达谱,并通过逆转录定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)技术进行了验证。结果显示,这些 BvAGO 蛋白被分为 4 个分支,蛋白质长度在 712 到 1142 个氨基酸之间。亚细胞定位预测表明,4 个 BvAGO 成员位于细胞质中,4 个位于细胞核中,1 个位于细胞外区域,且这 9 个基因分布在 5 条染色体上。总体而言,甜菜 AGO 基因成员和拟南芥(Arabidopsis thaliana)AGO 基因成员在组织中的表达模式非常相似,其中 BvAGO1、BvAGO4c、BvAGO5a和 BvAGO5b基因在所有组织中均高表达。研究人员推测这些基因可能参与甜菜相关单胚 - 多胚发育的调控,本研究为进一步研究甜菜中 AGO 蛋白的功能提供了指导。
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