Peribacillus sp. S4全基因组测序揭示其在堆肥氮代谢中的潜在应用价值

来自中国的研究团队针对堆肥过程中氨减排的生物转化难题，完成了Peribacillus sp. S4菌株的全基因组测序。该菌株染色体全长5,582,479 bp（GC含量40.49%），编码5,087个基因，鉴定出NRT、narK、nrtP、nasA等氮代谢相关基因及gltB、glnA、gudB等氮同化通路基因，为堆肥氮循环机制研究提供了重要分子基础。

　　

【前沿发现】
科研人员从哈尔滨污泥堆肥厂生物滤池(45°48′48″N 126°42′51″E)分离获得一株Peribacillus sp. S4。该菌株在含氨培养基(10 mL/L NH₃)中经四代纯化培养后，采用Illumina NovaSeq 6000与PacBio Sequel II双平台测序，获得覆盖度186×的完整环状染色体(5.58 Mb)。

【技术亮点】
通过tRNAscan-SE 2.0鉴定83个tRNA，RNAmmer 1.2定位45个rRNA。与近缘种Peribacillus frigoritolerans(ANI 98.39%)比较确认分类地位。PGAP 6.9注释显示其携带硝酸盐转运蛋白基因簇(NRT/narK/nrtP)和硝酸还原酶nasA，同时存在谷氨酸合成酶gltB、谷氨酰胺合成酶glnA等核心氮同化元件。

【应用前景】
该基因组特征提示菌株S4可能通过双重调控机制：既参与硝态氮吸收(NRT系统)，又介导氨同化(glnA/gudB通路)，为开发新型堆肥氨减排菌剂提供了优质基因资源。研究获得龙江环保集团资助，相关数据已提交国际基因库(CP091882)。