探秘裙带菜(Undaria pinnatifida):全基因组解析揭示多种核质病毒(Nucleocytoviricota)感染印记的重要意义

【字体: 时间:2025年05月04日 来源:Journal of Applied Phycology 2.8

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  为探究裙带菜(U. pinnatifida)的病毒感染情况,研究人员开展了全基因组分析。他们在韩国菌株基因组中发现近 551-Kb 的核质病毒(Nucleocytoviricota)内源性病毒元件,且在 43 个基因组中检测到相关病毒标记基因。这为研究裙带菜病毒感染提供了重要依据。

  裙带菜(Undaria pinnatifida)是一种原产于西北太平洋的大型褐藻,它被引入多个国家,还跻身世界 100 种最严重的入侵物种之列。不过,裙带菜可食用,还能产生多种生物活性化合物,在商业领域十分重要。尽管它有生态和经济价值,但对其病毒的研究才刚起步。
此次研究通过全种群基因组分析,探寻裙带菜中的病毒感染特征。在韩国菌株 Upin_Kr2015 基因组的假染色体上,发现了近乎完整的、长达 551-Kb 的核质病毒(Nucleocytoviricota)巨型内源性病毒元件。该病毒区域含有病毒标志性基因以及辅助代谢基因,比如激酶和 GDP - 甘露糖脱氢酶。此外,研究人员在分析的 43 个全基因组组装体中都检测到了病毒标志性基因,这些基因溯源至潘多拉病毒目(Pandoravirales)、藻病毒目(Algavirales)或拟病毒目(Imitevirales)。这些发现有力地证明了裙带菜经常受到多种核质病毒(Nucleocytoviricota)的感染。

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