紫花苜蓿 FIMBRIN 基因家族在非生物胁迫响应中的全基因组特征解析与意义探寻

【字体: 时间:2025年05月04日 来源:BMC Plant Biology 4.3

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  紫花苜蓿生长受非生物胁迫制约,FIMBRIN 基因家族作用不明。研究人员对紫花苜蓿 MsFIM 基因开展全基因组分析,鉴定出 6 个基因,发现其在组织中差异表达且响应非生物胁迫及激素处理。该研究为苜蓿抗逆机制研究提供新视角。

  在植物的微观世界里,细胞的各项活动有条不紊地进行着,而肌动蛋白细胞骨架就像是细胞内的 “脚手架”,支撑并参与着众多关键的生命过程,如细胞迁移、细胞器运输等。FIMBRIN 蛋白作为一类重要的肌动蛋白结合蛋白(ABPs),在调节细胞动态变化中发挥着关键作用。然而,目前关于 FIMBRIN 基因家族在植物应对非生物胁迫方面的机制,仍存在许多未知。
紫花苜蓿作为全球重要的牧草作物,富含蛋白质、矿物质等营养成分,不仅能为畜牧业提供优质饲料,还具有一定的药用价值。但它的生长常常受到高盐、干旱等非生物胁迫的影响,导致产量和品质下降。因此,挖掘紫花苜蓿中应对非生物胁迫的关键基因,成为了提升其抗逆性的关键。此前,FIMBRIN 基因家族的研究主要集中在拟南芥上,对于紫花苜蓿中该基因家族的研究十分有限。在此背景下,中国农业大学的研究人员开展了紫花苜蓿 FIMBRIN 基因家族的相关研究,成果发表在《BMC Plant Biology》上。

研究人员运用了多种关键技术方法。首先,通过 BLASTP 搜索和隐马尔可夫模型(HMM)分析,从紫花苜蓿基因组中鉴定 MsFIM 基因。利用多序列比对和系统发育树构建,探究基因进化关系。借助 RNA 测序(RNA-seq)和实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)技术,分析基因表达模式。此外,还通过构建载体和烟草瞬时转化实验,进行亚细胞定位研究。

紫花苜蓿 MsFIM 基因的鉴定与特征分析


研究人员通过全面筛选紫花苜蓿 “中苜 1 号” 基因组,共鉴定出 6 个 MsFIM 基因,它们分布在 3 条染色体上。构建系统发育树发现,MsFIM 基因家族可分为 4 个进化枝。对基因结构、保守基序和结构域分析显示,多数 MsFIM 蛋白含有保守基序和 CH 结构域,不同基因在结构上存在差异,如 MsFIM6 外显子最多,MsFIM4 最少。基因复制分析表明,MsFIM5 和 MsFIM6 存在大片段复制事件,这可能是该基因家族扩张的主要原因。

紫花苜蓿 MsFIM 基因的表达模式分析


组织特异性表达分析发现,MsFIM 基因在不同组织中呈现出组成型和组织特异性表达模式,多数基因在花和叶中表达较高。利用 RNA-seq 数据对不同花发育阶段的基因表达分析表明,MsFIM 基因在盛花期高表达,MsFIM1 - 4 和 MsFIM5、MsFIM6 分别呈现相似的表达趋势。在非生物胁迫和脱落酸(ABA)处理下,MsFIM 基因表达也发生变化,不同基因在干旱、寒冷、盐胁迫及 ABA 处理的不同时间点,表达量有升有降,表明它们在胁迫响应的不同阶段发挥着不同作用。

MsFIM5 的亚细胞定位


研究发现 MsFIM5 在花中特异性表达,且与 MsFIM6 在非生物胁迫下可能存在功能冗余。对 MsFIM5 进行亚细胞定位实验,结果显示 MsFIM5 - GFP 融合蛋白定位于烟草细胞的肌动蛋白细胞骨架上,这暗示 MsFIM5 可能通过调节细胞骨架动力学,在植物胁迫响应中发挥重要作用。

综合来看,该研究鉴定出紫花苜蓿中的 6 个 MsFIM 基因,它们均含有保守的 CH 结构域,且在进化上与双子叶植物和豆科作物关系密切。MsFIM 基因在花、茎、叶中高表达,尤其在盛花期表达量显著升高。同时,这些基因能够响应干旱、寒冷、盐胁迫及 ABA 处理,对紫花苜蓿抵抗非生物胁迫和生长发育具有重要意义。此研究为深入理解紫花苜蓿的抗逆分子机制提供了理论依据,也为后续通过基因工程手段改良紫花苜蓿的抗逆性奠定了基础。

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