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5′-tRNAHisGUG片段:一种具有反向序列激活特性的天然TLR7配体的发现及其机制研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月06日 来源:Biophysical Journal
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本研究针对合成TLR7激动剂毒性高的问题,发现天然tRNA片段5′-HisGUG和5′-ValCAC/AAC可作为高效TLR7激活剂。通过分子动力学模拟和MM/GBSA结合自由能分析,揭示其结合模式优于合成激动剂,且反向序列5′-HisGUG-Rev仍保持激活能力,为开发安全免疫疗法提供新策略。
在免疫治疗领域,Toll样受体7(TLR7)作为先天免疫的关键传感器,长期被视为抗病毒和抗癌药物的重要靶点。然而,现有合成TLR7激动剂如咪唑喹啉类化合物虽疗效显著,却常伴随全身性炎症反应等严重副作用,这促使科学家们寻找更安全的天然替代物。近年来,内源性RNA分子逐渐进入研究者视野——这些人体自身产生的物质理论上应具有更好的生物相容性。但谜题在于:究竟哪些特定RNA片段能有效激活TLR7?它们与受体的相互作用机制又如何?
针对这些问题,一项发表于《Biophysical Journal》的研究取得了突破性进展。研究人员发现转运RNA(tRNA)的特定片段——5′-tRNAHisGUG和5′-tRNAValCAC/AAC具有惊人的TLR7激活能力。更令人惊讶的是,即便将其序列反转(5′-HisGUG-Rev),这种激活效应依然存在。这一发现不仅拓展了对天然免疫激活剂的认知,更揭示了RNA序列排列可能并非TLR7识别的绝对决定因素。
为深入解析作用机制,研究团队采用了分子动力学模拟技术,动态追踪RNA片段与TLR7的结合过程,并结合MM/GBSA(分子力学/广义玻恩表面积)方法定量计算结合自由能。结果显示,这些tRNA片段的结合亲和力显著高于传统合成激动剂,其中5′-HisGUG与TLR7的结合自由能达-50.2 kcal/mol,比临床阶段化合物GS-9620(-43.1 kcal/mol)更具优势。自由能分解分析发现,tRNA片段主要通过磷酸骨架与TLR7的LRR12结构域形成强静电相互作用,而核苷酸碱基则参与关键的氢键网络构建。
研究特别关注了构象动态性对激活的影响。通过主成分分析发现,天然tRNA片段结合时诱导TLR7产生独特的构象波动模式,其均方根波动(RMSF)值比合成激动剂体系高30%-40%。这种增强的灵活性可能促进受体二聚化——这是TLR7信号传导的关键步骤。实验验证显示,5′-HisGUG-Rev处理免疫细胞后,干扰素-γ(IFN-γ)和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)mRNA表达水平提升2-3倍,证实其功能性激活效果。
研究结论部分强调三个核心发现:首先,tRNA片段作为进化保守的内源性分子,其TLR7激活效率可超越人工合成化合物;其次,反向序列保持活性的现象提示TLR7识别可能更依赖RNA二级结构而非严格序列特异性;最后,结合强亲和力与构象扰动能力的"双因素模型"可更好解释激活差异。这些发现为设计低毒性免疫调节剂提供了新思路——通过模拟天然RNA的构象动态特征,或可开发出"仿生型"TLR7调节剂。
该研究的创新性体现在首次系统比较内源与合成TLR7配体的作用机制差异,其揭示的构象灵活性作用机制为靶向TLR的药物设计开辟了新维度。未来研究可进一步探索其他非编码RNA片段的免疫调节潜力,或通过理性修饰优化tRNA片段的药代动力学特性。随着对RNA-受体相互作用认知的深入,源自生命本身的天然分子有望成为下一代免疫疗法的基石。
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