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埃塞俄比亚高粱(Sorghum bicolor)群体遗传多样性及结构解析:基于SSR标记的基因组学视角
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月11日 来源:Plant Molecular Biology Reporter 1.6
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来自埃塞俄比亚的研究团队通过14个SSR标记对96份高粱种质进行群体遗传学分析,揭示137个等位基因(平均9.8个/位点),PIC值0.54-0.9。研究发现99%变异源于个体内差异,Amhara、Tigray和Oromia地区呈现更高遗传多样性,为高粱育种和种质保护提供重要分子依据。
高粱(Sorghum bicolor (L.) Moench)作为全球重要的粮饲兼用作物,其遗传资源评估对育种至关重要。埃塞俄比亚研究者采用14个简单序列重复(SSR)分子标记,对全国96份高粱种质展开基因组扫描,共检测到137个等位基因,每位点平均9.8个。标记多态性信息含量(PIC)介于0.54-0.9之间,Nei遗传距离跨度达0.05-0.71。
通过UPGMA层级聚类、主坐标分析(PCoA)和STRUCTURE软件解析,发现种质形成四大类群,但地理起源界限模糊——分子方差分析(AMOVA)显示99%的变异存在于个体内部,仅1%与采集地相关,暗示高强度基因流的存在。值得注意的是,阿姆哈拉(Amhara)、提格雷(Tigray)和奥罗米亚(Oromia)地区的种质展现出更丰富的遗传多样性,这些"基因热点"区域可作为发掘育种优异等位基因的优先考察地。
该研究为高粱种质库建设提供了分子水平的决策依据,其揭示的跨区域基因交流现象,对理解作物适应性进化及制定原位保护策略具有启示意义。
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