更新 MPEXS2.1-DNA 蒙特卡罗代码:助力离子辐照下的水辐射分解模拟与放疗研究

【字体: 时间:2025年05月14日 来源:Scientific Reports 3.8

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  为提升放疗效果,尤其是离子束放疗效果,研究人员开展了 MPEXS2.1-DNA 蒙特卡罗代码更新研究。通过引入新模型和考虑多电离过程,模拟结果与实验数据吻合良好,计算速度大幅提升,有助于研究 DNA 损伤机制。

  在现代医学中,放疗是治疗癌症的重要手段之一,其中离子束放疗,如质子和碳离子束放疗,因其能在有效治疗肿瘤的同时,最大程度减少对周围健康组织的影响,受到了广泛关注。然而,要进一步优化放疗方案,就必须深入了解电离辐射引发的相互作用机制。在这一过程中,水辐射分解产生的间接作用对 DNA 损伤有着关键影响,其产生的羟基自由基等物质能破坏 DNA 结构,导致细胞损伤甚至死亡。据估算,在 X 射线照射下,间接作用对细胞存活的影响约占 80%。但目前,用于模拟水辐射分解和 DNA 损伤的 MPEXS2.1-DNA 蒙特卡罗模拟代码存在不足,其原始化学模型未涵盖反应活性氧物种(ROS,如 O-、O2、HO2等)的详细化学反应,无法准确计算离子辐照下的水辐射分解物种的辐射化学产率。因此,开展相关研究对完善放疗机制、提高放疗效果意义重大。
为解决这些问题,日本高能加速器研究组织(High Energy Accelerator Research Organization,KEK)等机构的研究人员对 MPEXS2.1-DNA 进行了更新研究 。研究人员通过引入基于格林函数扩散方程(GFDE)理论的替代分步(SBS)模型,并将其命名为 GFDE-SBS 模型,同时考虑了多电离过程。最终研究得出,该更新后的模型模拟结果与之前研究的实验数据吻合良好,计算速度相比原模型提升约十倍,且适用于长达数十秒的长时间模拟。这一成果对于准确模拟辐射相互作用、研究 DNA 损伤机制具有重要意义,相关论文发表在《Scientific Reports》上。

在研究方法上,研究人员主要运用了以下关键技术:一是基于 MPEXS2.1-DNA 和 RITRACKS 代码的模拟技术,利用 MPEXS2.1-DNA 在 GPU 设备上运行的优势,结合 RITRACKS 处理化学反应的能力,引入 GFDE-SBS 模型;二是设置模拟参数,采用 TRACIRT 代码的参数集,确定化学参数并自动计算相关反应参数;三是进行对比模拟实验,通过设置不同的粒子辐照条件,对比模拟结果与实验数据,如进行水辐射分解模拟和 Fricke 剂量计模拟。

下面来看具体的研究结果:

  • 辐射化学产率模拟结果:在电子辐照下,GFDE-SBS 模型能合理再现已发表数据趋势,与传统 SBS 模型(CONV-SBS)相比,由于考虑了静电作用力、自旋效应和背景反应,在某些分子物种的 G 值(辐射化学产率)上存在差异。例如,对于氢自由基,自旋效应使其组合自旋的单重态构型允许反应发生,使氢分子产率增加约 30%;对于 OH-阴离子,附近带电分子间的静电力作用使其产率增加约 10% 。在碳离子辐照下,该模型可精确追踪分子扩散,评估水辐射分解物种的 4 维演化,为预测 DNA 分子损伤位置提供了依据。此外,研究还对比了不同离子辐照下典型水辐射分解产物 G 值的 LET(线性能量转移)依赖性,模拟结果与实验数据相符。随着 LET 增加,eaq-和?OH 生成后消耗增强,化学产率单调下降;而 H2分子的 G 值则随 LET 增加而增加。对于过氧化氢(H2O2),在质子和 α 粒子辐照下,其 G 值随 LET 增加单调上升;在碳离子辐照下,当 LET 约为 200 keV/μm 时达到最大值,随后下降,这主要是由于多电离过程导致?OH 消耗增加,影响了 H2O2的生成 。
  • Fricke 剂量计模拟结果:通过 Fricke 剂量计模拟,研究人员验证了 GFDE-SBS 模型在长时间尺度模拟中的有效性。模拟结果显示,质子辐照数十秒后,Fe3+的辐射化学产率达到约 15.6 [species/100 eV],与国际辐射单位与测量委员会(ICRU)报告值相符,且计算的 G (Fe3+) 的 LET 依赖性也与实验数据一致,证实该模型适用于长达数十秒的模拟。
  • 计算性能评估结果:与 CONV-SBS 模型相比,GFDE-SBS 模型的计算性能显著提升,计算速度提高了约十倍。这主要是因为 GFDE-SBS 模型采用固定时间步长,而 CONV-SBS 模型的动态时间步长在分子物种密集生成时会缩短,导致计算时间延长。

在研究结论和讨论部分,研究人员通过更新 MPEXS2.1-DNA,引入 GFDE-SBS 模型和多电离过程,提升了离子辐照下的水辐射分解模拟能力。模拟结果能准确再现不同粒子辐照下各种分子物种的化学产率数据,且 GFDE-SBS 模型适用于长时间尺度的化学模拟,计算效率更高。这一成果对于定量评估离子诱导的 DNA 损伤程度和 DNA 修复过程具有重要意义,有望为放疗方案的优化提供理论支持。同时,该模型在超高剂量率(UHDR)条件下的水辐射分解模拟中也具有优势,有助于从计算机模拟研究中深入了解 FLASH 效应,为未来放疗技术的发展开辟新的道路。

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