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急性肝胰腺坏死病(AHPND)严重威胁凡纳滨对虾养殖,研究人员构建全同胞家系,通过全基因组重测序和分离群体分组分析(BSA),鉴定出与抗VpAHPND相关的基因,证实LvPLP1基因关键作用,为育种提供遗传基础。
在广袤的海洋世界里,虾类养殖是一项重要的产业。然而,有一种名为急性肝胰腺坏死病(Acute hepatopancreatic necrosis disease,AHPND)的 “恶魔”,正肆虐地危害着凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)的养殖。它由副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus,
VpAHPND)引发,自 2010 年在亚洲被发现后,迅速在全球传播开来。感染这种病菌的凡纳滨对虾,肝胰腺会严重萎缩,上皮细胞大量脱落,短短 20 - 30 天内,死亡率就接近 100% ,给亚洲和墨西哥的水产养殖业带来了超过 430 亿美元的巨额损失,让养殖户们苦不堪言。
面对这一严峻挑战,提升凡纳滨对虾的抗病能力迫在眉睫。传统的养殖方式难以抵御病害的侵袭,而分子标记辅助育种技术为解决这一问题带来了新的希望。在这样的背景下,中国的研究人员积极行动起来,开展了一项极具意义的研究。
研究人员来自广东的相关研究机构,他们构建了凡纳滨对虾的全同胞家系。通过精心设计的实验,对这些家系的后代进行VpAHPND感染挑战实验,评估它们的抗病能力。之后,对具有抗性和易感性的凡纳滨对虾进行测序,运用分离群体分组分析(Bulked segregant analysis,BSA)技术,深入挖掘与抗VpAHPND感染相关的基因和单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNP)。
这项研究取得了丰硕的成果,发表在了《Fish》杂志上。研究发现,通过 SNP 和插入缺失(Insertion - Deletion,INDEL)数据监测到 57 个支架(scaffolds),涉及 215 个注释基因,这些基因富集在丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen - activated protein kinase,MAPK)、叉头框蛋白 O(Forkhead box protein O,FoxO)等免疫相关通路中。其中,两个支架(Scaffold_1573 和 1504)含有 22 个具有非同义突变的注释基因,被重点关注。更为关键的是,研究人员鉴定出了一个关键的免疫相关基因LvPLP1,并通过双链核糖核酸(dsRNA)干扰实验,在VpAHPND感染挑战下,进一步证实了它的抗菌功能。当干扰LvPLP1基因时,凡纳滨对虾的死亡率以及肝胰腺中的弧菌载量显著增加,这充分表明LvPLP1基因是凡纳滨对虾抗VpAHPND感染的关键功能基因。
这一研究成果意义重大。它为培育抗 AHPND 的凡纳滨对虾亲本品系奠定了坚实的遗传基础,通过分子标记辅助育种技术,可以更精准地筛选出具有抗病能力的凡纳滨对虾,加速抗病育种进程,有效降低 AHPND 对虾类养殖的危害,保障水产养殖业的可持续发展。
研究人员在开展这项研究时,主要运用了以下关键技术方法:首先是构建凡纳滨对虾全同胞家系,为后续实验提供稳定的研究对象;其次进行全基因组重测序,全面获取基因组信息;再利用分离群体分组分析(BSA)技术,精准定位与抗VpAHPND感染相关的基因区域;最后通过 dsRNA 干扰实验,验证基因功能。
下面详细介绍研究结果:
- 实验虾和弧菌:凡纳滨对虾全同胞家系在广东茂名的广东 JingYang Biology Co., LTD 分别培育。实验前,平均体长约 5cm、体重 2 - 3g 的虾在实验水箱中适应环境,模拟自然光照,控制盐度为 30ppt、pH 为 8.2 。
- 凡纳滨对虾育种系中对VpAHPND抗性的评估:使用 TCBS 平板对虾肝胰腺和实验水箱水中的弧菌载量进行定量分析。注射后,肝胰腺弧菌浓度在 3 小时内逐渐上升,最高达 2.3×105CFU/mL。两个纯合育种系的凡纳滨对虾在VpAHPND感染后的累计存活率差异显著,分别为 66.7% 和 17.3%,而正常水平为 90%。
研究结论和讨论部分再次强调了 AHPND 对虾类养殖的严重影响,以及鉴定与抗病相关的 SNP 和基因的重要性。全基因组重测序能更精确地分析基因组区域,为研究提供了有力支持。研究人员鉴定出的基因和相关区域,尤其是LvPLP1基因,为进一步研究凡纳滨对虾抗VpAHPND感染的机制提供了关键线索,也为分子标记辅助育种提供了重要的理论依据,对推动虾类养殖业的健康发展具有不可忽视的作用。