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黑蝇（蚋科）具重要医学与兽医意义，但其线粒体基因组（mitogenomes）研究匮乏。本研究利用新一代测序技术对 5 种黑蝇（Simulium bidentatum、S. siripoomense等）的 mitogenomes 进行测序分析，发现其序列特征及选择压力差异，为蚋科系统发育研究提供新见解。
黑蝇（蚋科 Simuliidae）是全球分布的昆虫类群，在医学和兽医学领域具有重要意义，但目前关于其线粒体基因组（mitogenomes）的认知有限。本研究通过新一代测序技术，对五种黑蝇物种 —— 双齿蚋（
Simulium bidentatum）、Siripoom 蚋（
S. siripoomense）、窗蚋（
S. fenestratum）、Chamlong 蚋（
S. chamlongi）和五纹蚋（
S. quinquestriatum）的 mitogenomes 进行了测序。研究围绕序列长度、A+T 含量、A/T 偏倚、A+T 富集区、重叠及基因间隔区、核苷酸组成、相对同义密码子使用情况以及非同义 / 同义替换率（Ka/Ks）等展开全面比较分析，并结合 GenBank 中蚋科和长角亚目（Nematocera）物种数据探讨系统发育意义。
结果显示，这些 mitogenomes 长度在 15,739 至 16,451 碱基对（bp）之间，均包含 37 个基因且未发生基因重排。其中，tRNASer（Ser1）缺乏双氢尿嘧啶臂。对 45 个 Nematocera mitogenomes 中 13 个蛋白编码基因（PCGs）的选择压力分析表明，nd2、nd5、nd4l和nd1的 Ka/Ks 比值大于 1，提示较高的非同义替换速率；而cox1的 Ka/Ks 值最低，显示出强烈的纯化选择。系统发育分析支持蚋属内各亚属的单系性，但亚属间关系与以往研究存在差异。此外研究还发现，不同样本可能导致蚊总科（Culicomorpha）高级阶元系统发育结果的差异，而毛蚊总科（Bibionomorpha）中异足蚊科（Anisopodidae）的系统发育位置仍不明确，需进一步研究。
