GID4识别Pro/N-降解子肽段的动态机制:构象选择与诱导契合的协同作用

【字体: 时间:2025年05月18日 来源:Biophysical Journal 3.4

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  来自某研究团队(单位未明确)的科学家们通过分子动力学(MD)模拟和结合能计算,揭示了GID4识别Pro/N-降解子肽段的动态机制。研究发现,GID4通过其发夹环(L1-L4)的构象变化实现底物选择性结合,提出"构象选择+诱导契合"的混合识别模型,为调控蛋白质降解通路提供了新靶点。

  

在细胞蛋白质质量控制体系中,N-降解子(N-degron)通路扮演着关键角色,其核心识别元件GID4通过特异性结合N端含脯氨酸(Pro)或疏水残基的底物,引导它们进入泛素-蛋白酶体降解途径。最新研究采用分子动力学(MD)模拟技术,捕捉到GID4在非结合状态(apo state)时,其四个发夹环(L1-L4)会自发进行"开放-闭合"构象转换。这种动态特性使其能通过"构象选择"初步筛选含降解信号的肽段,随后通过"诱导拟合"调整环区结构实现紧密结合。有趣的是,虽然N端脯氨酸突变会削弱结合贡献,但对其他残基的相互作用影响甚微。该发现不仅阐明了GID4识别多类底物的分子机制,更为干预蛋白质稳态相关疾病(如神经退行性疾病)提供了理论依据。

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