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本综述聚焦榴莲（Durio spp.）基因组学研究，通过 PRISMA 方法筛选 32 篇文献，归纳遗传鉴定、多样性、分子标记（如 SSR）、测序（RAD、PacBio）等七大主题，探讨其在育种、进化及品质改良中的应用，指出果实品质分子标记开发等研究缺口。
榴莲（Durio spp.）作为锦葵科热带水果，其果肉富含碳水化合物、脂肪、纤维、维生素、矿物质、多酚及必需脂肪酸等营养物质，在全球贸易中占据重要地位，泰国、马来西亚和中国是其主要生产与消费国。本系统文献综述围绕榴莲基因组学展开，通过严格的标准和分析阶段，重点探讨其对育种的影响。研究采用 PRISMA 方法，最终筛选出 32 篇符合条件的文献进行深入分析。
榴莲基因组研究的七大主题
榴莲基因组研究可分为七个主题，分别为遗传鉴定、遗传多样性、分子标记开发、基因表达、基因组测序、全基因组分析和生物信息学。其中，遗传多样性和基因组测序是研究重点。在遗传多样性研究中，简单序列重复（SSR）标记被广泛应用于物种保护和育种评估，有助于了解不同榴莲种群的遗传差异和演化关系。
基因组测序技术与研究发现
限制位点相关 DNA（RAD）测序和 PacBio 测序技术在解析复杂的榴莲基因组中发挥了关键作用。通过这些技术，研究人员揭示了榴莲基因组中独特的基因扩增现象以及多倍化等进化事件，为深入理解榴莲的进化历程提供了分子层面的证据。系统发育分析则聚焦于锦葵目（Malvales），进一步阐明了榴莲的进化历史及其与近缘物种的亲缘关系。目前，相关研究主要集中在印度尼西亚和中国，这也反映了榴莲在这些地区的重要经济和农业价值。
基因组研究的应用与意义
基因组研究的成果为榴莲的保护策略制定、农业实践优化和育种工作提供了重要指导。通过解析榴莲的遗传多样性和适应性，研究者能够更有针对性地开展品种改良，例如培育具有更优抗病性或果实品质的榴莲品种。生物信息学的整合应用则在基因共线性比较和抗性基因类似物（RGA）鉴定等方面发挥了重要作用，进一步推动了对榴莲遗传学和农学特性的认知。特别值得关注的是，基因组学在揭示榴莲果实成熟机制方面具有关键作用，这对于提升果实品质和指导未来育种策略至关重要。
研究缺口与未来方向
尽管已有大量研究积累，榴莲基因组研究仍存在一些亟待填补的空白。例如，针对果实品质的分子标记开发尚显不足，利用全基因组测序技术分析本地榴莲遗传多样性的研究也有待加强。此外，在基因鉴定和全基因组分析领域，仍需开展更多深入研究，以全面揭示榴莲基因组的奥秘，为其可持续利用和产业发展提供更坚实的科学基础。
