牦牛附睾不同部位 N6- 甲基腺苷(m6A)特征分析

【字体: 时间:2025年05月20日 来源:BMC Genomics 3.5

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  为探究附睾中 m6A 修饰情况,研究人员对牦牛附睾头、体、尾的 m6A 水平及相关基因进行分析。发现附睾体 m6A 水平最高,不同区域差异甲基化 RNA 富集于精子成熟相关通路,为揭示精子成熟机制及男性不育提供新视角。

  
在生命的孕育旅程中,精子的成熟过程宛如一场精密编排的舞蹈,而附睾作为这场舞蹈的重要舞台,其背后的分子调控机制一直是生殖领域的研究热点。RNA 修饰作为基因表达调控的 “暗线”,尤其是 N6- 甲基腺苷(m6A)这种哺乳动物中最常见的 RNA 修饰,已被证实参与细胞发育、 gametogenesis 等多种生理过程。然而,在附睾这个精子成熟的关键场所,m6A 修饰的全景图谱及其对精子成熟的调控作用却一直笼罩在迷雾之中。已有的研究发现,附睾中微小非编码 RNA 的含量在精子成熟过程中发生显著变化,暗示表观遗传修饰可能扮演着重要角色,但 m6A 修饰的具体情况却无人涉足。解开这一谜团,不仅能揭示精子成熟的深层机制,更可能为男性不育的诊断和治疗打开新的窗口。

为了填补这一研究空白,中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所(甘肃省牦牛繁育重点实验室、农业农村部青藏高原动物遗传育种重点实验室)的研究人员联合海北州畜牧科技示范园管理委员会,开展了牦牛附睾 m6A 修饰的系统性研究。这项研究成果发表在《BMC Genomics》上,为理解附睾功能和精子成熟的表观遗传调控提供了关键数据。

研究人员主要采用了甲基化 RNA 免疫沉淀测序(MeRIP-seq)和 RNA 测序(RNA-seq)两项核心技术。他们从 6 头 4 岁健康雄性牦牛中采集附睾头、体、尾组织,通过组织学染色观察不同区域的结构差异,并利用 m6A 定量检测试剂盒测定各区域的 m6A 水平。随后,通过高通量测序和生物信息学分析,识别差异甲基化区域和基因,并结合功能富集分析探讨其生物学意义。

组织结构与 m6A 水平分布


组织学观察发现,附睾头的小管密集且管径较大,附睾体的管壁较厚、上皮细胞数量多,附睾尾则以高精子密度为特征,承担储存功能。m6A 水平检测显示,附睾体的 m6A 含量显著高于头和尾,且附睾体中 m6A “读者”(如 YTHDF2、YTHDC1)和 “ writers”(如 METTL14、WTAP)相关基因表达上调,而 “ erasers”(FTO、ALKBH5)基因表达下调,提示附睾体中 m6A 的动态平衡偏向于甲基化积累。

不同区域 m6A 修饰差异分析


MeRIP-seq 结果显示,附睾头和尾的 m6A 峰值数量较多,但分布特征相似,均主要集中在 mRNA 的外显子和 3'- 非翻译区(3'-UTR),且具有典型的 “RRACH” 保守基序。对比分析发现,附睾体与头的差异甲基化 RNA(DMR)富集于间隙连接、ErbB 信号通路和 mTOR 信号通路,这些通路与细胞通讯和精子成熟密切相关;而附睾尾与体的 DMR 则富集于细胞凋亡、FoxO 信号通路和 PI3K-Akt 信号通路,涉及精子自噬、氧化应激等过程。

基因表达与 m6A 修饰的关联


RNA-seq 分析筛选出大量差异表达基因(DEGs),结合 m6A 数据发现,部分关键基因如 YY1-associated factor 2(YAF2)、forkhead box J2(FOXJ2)和 forkhead box O1(FOXO1)的 m6A 水平显著变化,但 RNA 表达量无差异,提示 m6A 修饰可能在翻译水平调控这些基因,进而影响精子成熟。qRT-PCR 验证了部分基因的表达趋势,与测序结果一致。

研究结论与意义


本研究首次绘制了牦牛附睾不同区域的 m6A 修饰图谱,发现附睾体是 m6A 修饰的核心区域,其高甲基化状态可能通过调控间隙连接、mTOR 等信号通路促进精子成熟,而附睾尾的低甲基化状态则与精子的储存和功能维持相关。研究还识别出 YAF2、FOXJ2、FOXO1 等关键基因,揭示了 m6A 修饰在翻译水平调控精子成熟的新机制。这些发现不仅丰富了附睾表观遗传学的研究内容,也为深入理解男性不育的分子机制提供了新靶点,有望为相关疾病的诊断和治疗策略开发提供理论依据。此外,牦牛作为青藏高原的重要经济动物,其生殖调控研究也为 livestock 遗传改良和繁殖效率提升提供了参考。

这项研究通过多组学技术的整合,系统解析了附睾 m6A 修饰的时空分布规律及其与精子成熟的关联,为生殖生物学领域开辟了新的研究方向。未来,进一步探究 m6A 修饰相关酶的动态调控机制及跨物种保守性,将有助于全面揭示精子成熟的表观遗传网络,为人类生殖健康和动物繁殖技术的发展奠定更坚实的基础。
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