维生素 D?干预对免疫细胞转录组的调控及个体应答差异研究

【字体: 时间:2025年05月20日 来源:Scientific Reports 3.8

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  为探究维生素 D?对免疫细胞转录组的影响及个体应答差异,研究人员对 45 名健康参与者进行单次维生素 D?冲击(1,000 IU/kg),检测干预前后基因表达。发现 758 个基因显著调控,且个体分为高 / 中 / 低应答者,为维生素 D 补充策略提供依据。

  
维生素 D 作为维持人体健康的重要营养素,其对免疫系统的调控机制一直是生命科学领域的研究热点。目前,尽管已有研究表明维生素 D 与免疫功能密切相关,但个体对维生素 D 补充的应答差异显著,且其在转录水平上的调控网络尚未完全明晰。例如,不同人群中维生素 D 缺乏的发生率差异较大,而补充维生素 D 后的健康效益却呈现不一致性,这提示深入探究维生素 D 作用的分子机制及个体应答差异的成因具有重要科学意义。

为解决上述问题,来自欧洲的研究人员开展了 VitDPAS 研究,该研究成果发表在《Scientific Reports》。研究旨在通过分析维生素 D?干预前后免疫细胞的转录组变化,揭示维生素 D 调控的关键基因和信号通路,并解析个体间应答差异的分子基础,为精准营养干预提供理论依据。

研究人员采用单次大剂量维生素 D?冲击(1,000 IU/kg 体重)的干预方式,对 45 名健康参与者(23 名女性、22 名男性,年龄 24-64 岁)进行研究,分别在干预前(d0)和干预后 24 小时(d1)采集外周血单个核细胞(PBMC),利用 RNA 测序(RNA-seq)技术分析转录组变化。同时,结合多维标度分析(MDS)、差异基因表达分析及功能富集等方法,系统解析维生素 D?的基因调控网络。

维生素 D?干预对转录组的显著影响


RNA-seq 数据显示,维生素 D?干预后,45 名参与者的 PBMC 转录组发生显著变化。通过差异基因表达分析(p<0.05),共鉴定出 758 个显著调控的基因,其中 369 个上调、389 个下调。进一步通过严格筛选标准(绝对 log?FC>0.25 且 FDR<0.05),确定了 70 个高可信度维生素 D 靶基因,包括 15 个上调基因和 55 个下调基因。MDS 分析显示,d1 样本与 d0 样本在转录组层面呈现明显分离,表明维生素 D?干预可快速诱导免疫细胞基因表达的广泛改变。

个体应答差异的分类与机制


研究通过计算个体的维生素 D 应答指数(基于靶基因表达变化幅度与维生素 D 状态提升比例的相关性),将参与者分为高应答者(17 人)、中应答者(19 人)和低应答者(9 人)。分析表明,应答指数与基线维生素 D 状态呈弱正相关(r=0.61),但与年龄、BMI 无显著相关性。进一步结合另一项 VitDHiD 研究数据,发现两项研究共鉴定出 232 个共同靶基因,联合分析显示 88.6% 的参与者分类结果一致,提示个体应答差异具有跨队列的稳定性。

关键信号通路与功能富集


通过 STRING 数据库和功能注释分析,维生素 D 靶基因主要富集于炎症反应(如 TNFAIP3、NFKBIA)、免疫细胞迁移(如 S1PR1、CXCR4)、转录调控(如 PER1、HIF1A)、应激反应(如 GADD45B、CDKN1A)及代谢稳态(如 GLUL、NAMPT)等功能类别。KEGG 通路分析显示,TNF 信号通路和 NFκB 信号通路是维生素 D 调控的核心通路,其中多数基因(如 TNFAIP3、NFKBIA)在干预后呈下调趋势,提示维生素 D 可能通过抑制促炎通路维持免疫稳态。值得注意的是,约 15.7% 的个体表现出靶基因上调的异常应答,暗示存在复杂的个体调控机制。

研究结论与意义


本研究通过大样本队列和转录组分析,系统揭示了维生素 D?干预对免疫细胞转录组的动态调控规律,鉴定了以 NFκB 和 TNF 信号通路为核心的维生素 D 靶基因网络,并明确了个体应答差异的分子特征。研究发现,尽管个体间存在显著的基因表达差异,但仍有 26 个核心基因在多项研究中稳定调控,为维生素 D 的功能机制提供了新的靶点。此外,研究首次提出维生素 D 应答指数的跨地域验证,发现北欧人群中低应答者比例显著低于赤道附近人群,这为不同地区的维生素 D 补充策略提供了流行病学依据。

该研究不仅深化了对维生素 D 免疫调控机制的理解,也为精准营养干预和个性化健康管理提供了重要理论支持。未来研究可进一步结合表观基因组学(如 ATAC-seq)和临床表型数据,全面解析维生素 D 应答差异的遗传和环境基础,推动维生素 D 在疾病预防和治疗中的精准应用。

研究中主要使用的技术方法包括:RNA 测序(RNA-seq)用于转录组分析,多维标度分析(MDS)用于数据降维和样本聚类,差异基因表达分析(以 CPM>10 为表达阈值,采用配对 T 检验和 FDR 校正)筛选显著调控基因,STRING 数据库构建蛋白质互作网络,EnrichR 和 KEGG 进行功能通路富集分析。样本队列来自波兰健康人群,干预方式为单次口服维生素 D? bolus(1,000 IU/kg),血液样本采集于干预前后特定时间点。

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