巴基斯坦口蹄疫病毒(FMDV)血清型的分子特征与流行病学解析及其进化动态研究

来自巴基斯坦的研究人员针对口蹄疫病毒(FMDV)血清型遗传变异数据匮乏的问题，开展了基于全基因组测序的进化分析。研究解析了O型(Pak-98谱系)、A型(基因型I)和Asia-1型(第5群)三种血清型的基因组特征，发现VP1/VP3蛋白编码区存在显著负选择位点，揭示了多血清型共循环的流行态势，为疫苗研发和跨境防控提供了关键分子依据。

　　

口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus, FMDV)在偶蹄动物中引发具有高度传染性的跨境传播疾病。针对巴基斯坦FMDV毒株基因组进化研究稀缺的现状，科学家们对该国疫情暴发样本展开调查，成功获得O型、A型和Asia-1型三种血清型的全基因组序列。比较基因组分析显示，这些毒株与周边亚洲国家流行株存在密切关联。

基于全基因组和VP₁基因的系统发育分析表明：O型毒株聚集于Pak-98进化支，A型归类于基因型I，Asia-1型则属于第5群，与巴基斯坦、印度和中国毒株形成聚类。在编码结构蛋白VP₄、VP₃、VP₂和VP₁的区域中，研究者发现了潜在的负选择位点，其中VP₁和VP₃区域呈现最显著的片段多样性。多态性位点分析显示，O型病毒的VP₁蛋白具有最高变异度，但未检测到重组事件。

该研究首次系统揭示了巴基斯坦境内多血清型FMDV毒株的共循环现象，预警了新变异株出现的风险。这些发现不仅丰富了FMDV血清型遗传变异数据库，更为精准疫苗设计和跨国界疫情防控策略优化提供了分子流行病学依据。