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葡萄酒酵母编码微卫星中多态性氨基酸长度变化对蛋白质结构及功能的影响研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年05月27日 来源:Molecular Genetics and Genomics 2.3
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推荐 为探究酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)微卫星位点变异对蛋白质功能的影响,研究人员分析了H. uvarum、S. cerevisiae等五种酵母的编码微卫星。结果显示,YPL009c和SCYOR267C位点的TRM变化显著影响Rqc2和Hrk1蛋白结构,但未导致功能丧失,提示基因背景可能调节表型。该研究揭示了编码微卫星在酵母中的普遍性及其潜在作用机制。
翻译
葡萄酒酵母编码微卫星中多态性氨基酸长度的变化:不同的酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)YPL009c和SCYOR267C等位基因预测编码具有显著一级序列和结构改变的蛋白质,但未表现出明显的功能破坏。
酵母微卫星位点由可变长度的短串联重复DNA序列组成,这些序列可用于菌株区分、群体遗传学和进化生物学研究。先前的研究表明,除了串联重复基序(TRM)的可变数量外,某些酵母微卫星位点的等位基因变异还依赖于其TRM侧翼的单核苷酸多态性(SNP)和/或缺失插入(indels)。在本研究中,我们发现H. uvarum、S. cerevisiae、T. delbrueckii、B. bruxellensis和M. guilliermondii等葡萄酒酵母的某些微卫星位点的TRM位于蛋白质编码序列内,其中大多数导致预测的多态性带电氨基酸残基(即E、Q、D和N)区域。
计算机模拟分析表明,S. cerevisiae微卫星YPL009c和SCYOR267C的TRM长度变化显著破坏了其编码蛋白Rqc2和Hrk1的结构。携带可能破坏Rqc2和Hrk1功能的TRM等位基因的本地S. cerevisiae菌株并未表现出与ΔRQC2和ΔHRK1缺失菌株相似的对环己酰亚胺和乙酸的敏感性增加现象。有趣的是,携带相同TRM等位基因的S. cerevisiae分离株在环己酰亚胺或乙酸处理下表现出不同的生长行为,这表明基因组背景对观察到的表型有贡献。
综合来看,我们的结果表明,编码微卫星在葡萄酒酵母中较为常见,并可能位于不影响蛋白质功能的区域,或者位于具有高度结构可塑性的蛋白质区域。
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