中国大口黑鲈(Micropterus salmoides)不同种群的遗传多样性分析与荧光标记微卫星DNA指纹图谱构建

为解决中国大口黑鲈(Micropterus salmoides)种质资源鉴定与遗传多样性保护问题，研究人员通过荧光标记微卫星标记技术，对10个养殖种群进行遗传分析。研究发现种群间遗传分化显著（Fst 0.013-0.258），构建的DNA指纹图谱可精准区分杂交群体（如FLMB♀*YL3♂）和本土选育品种（如"优鲈3号"），为种质溯源和知识产权保护提供技术支撑。

　　

在中国水产养殖业中，大口黑鲈（Micropterus salmoides, LMB）作为重要的经济鱼类，其种质资源管理长期面临两大挑战：一是自1983年从台湾引入后，长期近亲繁殖导致遗传多样性下降近40%；二是不同地区选育的种群（如"优鲈1号"GS01-004-2010和"优鲈3号"GS-01-001-2018）缺乏有效的分子鉴定手段。珠江水产研究所的研究团队发现，尽管通过重新引入北方亚种（NLMB）和佛罗里达亚种（FLMB）可提升遗传多样性，但种群间遗传背景混杂问题日益突出。

为建立精准的种质鉴定体系，研究人员收集了广东、浙江等主产区的10个LMB种群（含2个杂交群体NF/FN），采用荧光标记微卫星技术进行高通量分析。关键技术包括：1) 从15对引物中筛选出7对多态性标记（如MisaTPW12等位基因数达11个）；2) 基于ABI 3730XL毛细管电泳检测53个等位基因；3) 通过STRUCTURE和UPGMA分析群体结构；4) 建立数字化DNA指纹编码系统（0/1矩阵）。

遗传多样性分析
7个微卫星位点共检测到53个等位基因，平均每个位点7.571个。杂交群体NF的遗传多样性最高（等位基因数N_a=5.143，期望杂合度H_e=0.651），而韶关群体SG最低（N_a=1.714）。重引入的北方野生群体（NB）保持较高多样性（H_e=0.509），显著优于长期养殖的台湾群体（TW，H_e=0.299）。

群体遗传结构
STRUCTURE分析显示当K=4时，300个个体被分为4簇：第2簇包含全部NF个体和80%的ZZ群体，证实福建漳州群体可能含有杂交成分。AMOVA表明83.77%的变异来自个体内，仅16.23%源于群体间差异，说明种内分化主要源于随机遗传漂变。

DNA指纹图谱应用
在Lma120位点，NB群体特有的201bp片段和YL3群体的207bp片段可作为品种特异性标记。数字化指纹成功匹配验证样本（如C-NB-1在Mdo6位点显示NB特有序列"01010"），对杂交后代鉴定准确率达100%。

该研究首次建立了覆盖中国主要LMB养殖群体的分子身份证体系，其重要意义体现在：1) 为"优鲈3号"等新品种知识产权保护提供法律依据；2) 揭示杂交育种（如FLMB^♀*YL3^♂）可显著提升遗传多样性（NF群体PIC=0.597）；3) 发现韶关群体（SG）因长期隔离养殖形成独特遗传特征（F_st达0.258）。论文发表于《BMC Genomics》，为水产种业可持续发展提供了关键技术支撑。