树鼩肝炎病毒与戊型肝炎病毒的基因组特征解析及其作为实验动物模型的启示

本研究针对树鼩(Tupaia belangeri)作为肝炎病毒研究模型时存在的自然感染病毒谱系不明问题，通过RNA测序技术鉴定出树鼩肝组织中新型肝炎病毒1/2型(TSHepaci1/2)和戊型肝炎病毒(TSPegi)，完成全基因组测序(登录号LC859347-349)，揭示其与啮齿类/蝙蝠源病毒的进化关联。发现70.3%实验用树鼩携带TSHepaci1且40.5%存在共感染，血清ALT显著升高，为规范实验动物筛选和病毒-宿主互作研究提供重要依据。

　　

在病毒学研究领域，树鼩(Tupaia belangeri)因其与灵长类的遗传相似性和对HBV/HCV的易感性，正逐渐成为替代非人灵长类的重要实验动物。然而，这种小型哺乳动物体内自然携带的病毒群落长期未被系统解析，这不仅可能影响实验结果的可靠性，更隐藏着人兽共患病风险。东京都医学研究所的Takahiro Sanada团队在《Infection, Genetics and Evolution》发表的研究，首次绘制了树鼩肝脏病毒组的完整图谱。

研究团队利用Illumina HiSeq2000平台对37只实验室饲养树鼩的肝脏样本进行RNA测序，通过MEGAHIT组装和RACE技术获得病毒全基因组。采用定量PCR检测病毒感染状态，结合SignalP 6.0等生物信息学工具预测蛋白修饰位点，运用MEGA11构建系统发育树。

研究结果部分：

1. 病毒组分析揭示树鼩肝炎病毒和戊型肝炎病毒存在
   从肝脏RNA文库中鉴定出9236bp的TSHepaci1和9167bp的TSHepaci2，均编码2865个氨基酸的多聚蛋白，5'UTR含有miR-122结合位点；而10991bp的TSPegi缺乏该特征。

2. 树鼩病毒的基因组特征
   TSHepaci1/2的E1/E2蛋白分别预测有3/5个N-糖基化位点，NS3和NS5B区域保守性最高。与啮齿类肝炎病毒(Hepacivirus P)的氨基酸同源性达55.2%，但NS3区p距离>0.25，符合新种标准。

3. 遗传亲缘性分析
   系统发育树显示TSHepaci1/2与长尾地松鼠病毒聚簇，而TSPegi与蝙蝠源Pegivirus scotophili亲缘最近，NS5B区p距离仅0.3。

4. 树鼩病毒感染检测
   70.3%(26/37)个体感染TSHepaci1(10²-10⁶ copies/μg RNA)，其中40.5%(15例)共感染TSHepaci2，仅2.7%(1例)单独携带TSPegi。

5. 血清ALT活性测定
   共感染组ALT水平显著高于未感染组(p<0.05)，提示病毒可能引发肝炎。单感染TSPegi的个体也呈现ALT升高。

这项研究不仅填补了树鼩病毒组学的空白，更揭示了三个关键发现：首先，实验用树鼩普遍携带肝炎病毒，可能通过miR-122介导的肝嗜性机制影响HBV/HCV研究结果；其次，共感染现象暗示病毒间存在未知互作关系；最后，病毒跨物种传播特征为理解Flaviviridae科进化提供新线索。研究人员强调，建立无特定病原体(SPF)树鼩种群和定期病毒筛查，将是提升动物实验可靠性的必要措施。该成果为规范树鼩模型应用树立了新标准，同时为探索肝炎病毒的宿主适应性进化机制开辟了新途径。