独特即食软米的遗传解析与分子育种：改善血糖反应的新策略

针对低直链淀粉软米(Vogali Bora)即食性(RTE)与高血糖反应(GR)的矛盾，研究者通过全基因组解析、转录组分析和分子标记辅助育种，发现淀粉合成基因(SSRGs)特异性变异是RTE性状的关键，成功培育出直链淀粉(AC)提升的F2:3 品系，显著改善GR。该研究为开发健康即食主食提供新思路。

　　

在传统饮食文化中，印度阿萨姆邦特有的"Komal Chaul"软米以其独特的即食性(Ready-to-Eat, RTE)闻名——仅需冷水浸泡即可食用，无需加热。这种神奇特性源于其低直链淀粉(Amylose Content, AC)与高支链淀粉(Amylopectin, AP)的组成，但同时也带来健康隐患：低AC会导致餐后血糖飙升(Glycemic Response, GR)，对糖尿病患者构成风险。随着全球即食食品需求增长，如何平衡RTE特性与健康效益成为关键科学问题。

针对这一挑战，由国防生命科学研究委员会资助的研究团队对典型软米品种Vogali Bora展开多维度研究。通过比较正常稻米IR36，研究者系统分析了软米的烹饪特性、淀粉组成、基因组特征和转录调控网络，并利用分子标记辅助育种培育改良品系。相关成果发表在《Journal of Cereal Science》上。

研究采用全基因组重测序锁定65个淀粉合成相关基因(Starch Synthesis Related Genes, SSRGs)的SNP变异，结合发育籽粒转录组揭示基因表达模式；通过分子标记RM190筛选重组自交系(RILs)，测定F_2:3
代种子的AC、RS含量，并建立小鼠模型评估GR改善效果。

【Exclusive RTE and quality traits of soft rice】
研究发现软米在室温水中66分钟即可软化（IR36无此特性），其AC/AP比值(9.3%)显著低于IR36(24.8%)，且抗性淀粉(Resistant Starch, RS)含量仅为0.2%。热力学分析显示软米糊化温度降低12°C，证实低AC是RTE性状的生化基础。

【Genetic basis of RTE trait】
基因组分析揭示软米虽属粳稻(japonica)，但其SSRGs存在大量特异性SNP，尤其在GBSSI(Waxy基因)和SSS(可溶性淀粉合成酶)位点。转录组显示籽粒灌浆期SSRGs普遍下调，其中AGPase(ADP葡萄糖焦磷酸化酶)表达量仅为IR36的1/3，解释其低AC特性。

【Molecular breeding for GR improvement】
利用RM190标记筛选的RILs保持RTE特性，但AC需<20%才能维持软度。成功培育的F_2:3
品系AC提升至15.7%，RS增加5倍，小鼠实验显示血糖峰值降低34%，证实分子育种可有效改善GR。

该研究首次阐明软米RTE性状的分子机制：特异性SSRGs变异导致淀粉合成途径重塑，形成低AC/AP比的独特淀粉颗粒结构。通过标记辅助育种突破"软度-GR"的负相关，为开发健康即食主食提供新范式。值得注意的是，研究发现的SSRGs调控网络（如AGPase-SSS-SBE级联）不仅适用于水稻改良，也为其他谷物品质育种提供参考。团队特别指出，未来需扩大种群验证RM190标记的普适性，并探索RS合成的关键限速酶。这项源自印度传统作物的研究，为应对全球糖尿病防控与便捷饮食需求矛盾提供了创新解决方案。