从短尾鼩鼱分离的哺乳动物正呼肠孤病毒3型全基因组测序及进化特征分析

来自佛罗里达大学的研究人员对一例短尾鼩鼱(Blarina peninsulae )源性哺乳动物正呼肠孤病毒(MRV)进行全基因组测序，通过Illumina平台获得10条编码完整基因片段，经系统发育分析鉴定为MRV-3型新毒株（与NC_013231.1同源性达92.62%），揭示了该人兽共患病毒在野生动物宿主中的遗传特征，为跨物种传播机制研究提供重要数据。

　　

科研团队从美国佛罗里达州盖恩斯维尔市一只被家猫捕杀的短尾鼩鼱(Blarina peninsulae
)脾肾组织中，成功分离出一株能诱导Vero E6细胞产生细胞病变效应(CPE)的病毒。通过高通量测序和从头组装(de novo
assembly)，获得该病毒10条双链RNA(dsRNA)基因组的完整编码序列，平均测序深度达2,119X。

基因分析显示该毒株具有典型哺乳动物正呼肠孤病毒(MRV)的基因组结构：3个L片段编码λ类蛋白（包括RNA依赖的RNA聚合酶λ3），3个M片段编码μ类蛋白（如负责病毒外衣壳组装的μ1C），以及4个S片段编码σ类蛋白（其中病毒附着蛋白σ1决定血清型）。通过σ1基因系统发育树比对，确认该毒株为MRV-3型新成员，命名为盖恩斯维尔鼩鼱MRV-3型UF-1株。

值得注意的是，μ2蛋白的干扰素调控功能及σ3蛋白的核质穿梭特性，暗示该毒株可能具有独特的宿主免疫逃逸机制。研究首次在鼩鼱目动物中发现MRV-3型感染，为理解这类可感染人类（引起呼吸道/神经系统疾病）的病毒在野生动物-家养动物-人类之间的传播链提供了关键分子证据。