碱盐胁迫下狗牙根根系qRT-PCR内参基因的筛选与验证研究

【字体: 时间:2025年06月13日 来源:Physiology and Molecular Biology of Plants 3.4

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  为解决碱盐胁迫下狗牙根(Cynodon dactylon)根系基因表达分析中内参基因稳定性不足的问题,研究人员通过geNorm、NormFinder等工具系统评估EF1α、TIP41等7个候选基因,最终确定EF1α为最稳定内参,为植物逆境分子机制研究提供关键技术支撑。

  

实时荧光定量PCR(qRT-PCR)作为基因表达分析的黄金标准,其数据可靠性高度依赖于内参基因的选择。面对碱性盐胁迫这一特殊环境压力,科研团队以狗牙根(Cynodon dactylon)根系为研究对象,展开了一场精密的"基因稳定性选拔赛"。

候选阵容包含EF1α、PP2A、TIP41等7个经典管家基因,研究人员运用geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder四套评估系统,从引物特异性、扩增效率到表达稳定性进行多维考核。琼脂糖凝胶电泳显示清晰的单一条带,熔解曲线呈现完美单峰,这些实验证据为后续分析奠定质量基础。

ΔCt值初步筛选显示EF1α、TIP41和GAPDH表现优异,而综合四大软件的分析结果一致将EF1α推上冠军宝座。为验证这一发现,团队巧妙结合转录组数据和核心基因qRT-PCR验证,最终确认EF1α在碱盐胁迫条件下具有卓越的表达稳定性。

这项研究不仅为狗牙根逆境生物学研究提供了可靠的内参选择方案,更通过系统性的评估方法,为其他非模式植物的基因表达研究树立了技术范本。当植物根系遭遇盐碱"围攻"时,EF1α就像一把精准的分子标尺,帮助科学家们丈量基因表达的细微变化,揭示植物适应逆境的奥秘。

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