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结合傅里叶变换红外光谱与理论折叠模型解析SARS-CoV-2单链RNA关键序列结构
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月13日 来源:European Biophysics Journal 2.2
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为解决RNA结构解析技术空白,研究人员通过傅里叶变换红外光谱(FTIR)结合计算模型,首次对野生型SARS-CoV-2病毒的单链RNA(ssRNA)进行结构解析,识别出糖-磷酸骨架、碱基-糖苷键及碱基振动特征谱区,并通过折叠预测获得其二/三级结构,为病毒RNA传感技术开发提供新思路。
傅里叶变换红外光谱(FTIR)作为分子结构敏感的振动光谱技术,虽广泛应用于蛋白质和DNA二级结构分析,却在核糖核酸(RNA)领域研究甚少。本研究以野生型SARS-CoV-2病毒体外转录稳定的单链RNA(ssRNA)为对象,通过FTIR光谱技术锁定四个关键谱区:糖-磷酸骨架振动、碱基-糖苷键耦合振动以及碱基特征振动模式。基于核苷酸序列,采用双重折叠预测算法推演出该RNA片段最可能的二级与三级结构,最终通过实验数据验证实现多维结构解析。该成果不仅推进了对SARS-CoV-2病毒RNA结构组的认知,更揭示了FTIR技术在RNA结构生物学中的独特潜力,为开发高灵敏度病毒RNA检测技术奠定理论基础。
(注:图形摘要中展示的FTIR特征峰与预测结构模型对应关系图未作文字转译)
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