云南树鼩病毒组解码:揭示新型病毒多样性及其人兽共患病潜力

【字体: 时间:2025年06月18日 来源:Virologica Sinica 4.3

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  本研究针对树鼩(Tupaia belangeri)作为潜在人兽共患病病毒库的科学盲区,采用病毒宏基因组测序技术对云南地区76份样本进行检测,鉴定出18个病毒科的基因组片段,其中13个含哺乳动物病毒。研究首次获得12个完整病毒基因组(包括5种细小病毒Parvoviruses、3种指环病毒TTVs、2种腺病毒Adenoviruses、1种肺病毒Pneumovirus和1种丙肝病毒Hepacivirus)及3个部分基因组,发现指环病毒TSTTVs可能构成Anelloviridae科新属,并揭示细小病毒TSParvoV-HNU5存在鼠源病毒重组现象。该成果为理解树鼩作为自然病毒库的生态作用提供了重要数据支撑,对预测人兽共患病风险具有预警价值。

  

在人类与野生动物接触日益频繁的背景下,约三分之二的新发传染病病毒源自野生动物。树鼩作为一种遗传学上更接近人类的特殊小型哺乳动物,不仅是重要的实验动物模型,更因其广泛分布于中国西南地区而成为潜在病毒"储藏库"。然而,当前对树鼩携带病毒的认识仍存在巨大空白,这种认知缺失可能阻碍我们对人兽共患病风险的预判。

为系统解析这一问题,来自大理大学等机构的研究团队在《Virologica Sinica》发表了突破性研究成果。研究人员采集云南地区76只树鼩的组织和拭子样本,通过病毒宏基因组测序结合PCR验证的技术路线,构建了迄今最全面的树鼩病毒组图谱。关键技术包括:样本分区处理(口腔/肛门拭子及心肾等6类组织)、核酸酶预处理去除宿主干扰、Illumina HiSeq-PE150平台测序,以及针对7类病毒的特异性PCR引物设计。

病毒组特征分析
研究检测到18个病毒科的序列片段,其中Parvoviridae、Siphoviridae和Anelloviridae占比最高。值得注意的是,口腔拭子中动物病毒序列占比超80%,而肺组织样本特异性富集指环病毒序列。

细小病毒遗传特征
获得的5种树鼩细小病毒中,TSParvoV-HNU1/3与花栗鼠病毒同源性最高(50%),TSParvoV-HNU5与鼠微小病毒同源达83.6%。SimPlot分析揭示TSParvoV-HNU5存在鼠细小病毒与大鼠病毒的重组事件,暗示跨物种传播可能。

指环病毒新分类单元
3种树鼩指环病毒TSTTV-HNU1/2/3的ORF1序列相似性达96.4-99.6%,系统发育分析表明其可能构成Anelloviridae科的新属,为病毒分类学提供新认知。

腺病毒与肺病毒进化
腺病毒TSAdV-HNU2与已知树鼩腺病毒TSAdV-1聚合酶同源性达97.5%。肺病毒TSPenV-HNU1与SPV_57的L蛋白同源99.2%,分子钟分析显示二者分化时间为1993-2007年。

肝炎相关病毒发现
丙肝病毒TSHV-HNU1与啮齿类丙肝病毒RHV-GS2015的NS3/NS5B蛋白同源63-67%,而部分HEV基因组片段与已知树鼩HEV同源达89-97.8%,强化了树鼩作为肝炎研究模型的适用性。

该研究首次系统揭示树鼩携带病毒的惊人多样性,其中细小病毒重组事件和指环病毒新分类单元的发现尤为突出。这些发现不仅填补了树鼩病毒组的知识空白,更提示需要关注树鼩-啮齿类-人类之间的病毒传播链。特别值得注意的是,研究检测到的肺病毒与犬/鼠源病毒高度同源,暗示树鼩可能在呼吸道病毒生态传播中扮演关键角色。

从公共卫生视角看,该成果为云南地区人兽共患病监测提供了重要本底数据。技术层面,建立的病毒宏基因组与靶向PCR联用策略,为野生动物病毒筛查提供了可借鉴的方法学框架。未来研究可进一步聚焦这些病毒的人源细胞感染实验,评估其实际跨种传播风险,为传染病早期预警系统建设提供科学依据。

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