智利大都会区猫科动物杯状病毒（FCV）GI.1与GI.2亚群的分子特征及流行病学意义

本研究针对智利大都会区猫科动物杯状病毒（FCV）的流行病学与分子特征展开，首次揭示了当地FCV的高流行率（48.8%）及GI.1/GI.2亚群的遗传多样性（69.45-100%核苷酸相似性）。通过RT-PCR和系统发育分析，发现疫苗逃逸株占19%，且GI.1亚群为主导，其5'HVR_E区氨基酸差异提示抗原性变异。研究挑战了VSD-FCV（强毒系统性疾病株）复制效率必高于URTD-FCV（上呼吸道疾病株）的假设，为区域特异性疫苗研发提供关键依据。

　　

猫科动物杯状病毒（Feline calicivirus, FCV）是全球猫科动物上呼吸道疾病（URTD）的主要病原体，其高突变率导致抗原多样性，使得疫苗防控面临挑战。更令人担忧的是，自2000年以来出现的强毒系统性疾病（Virulent Systemic Disease, VSD）变种，死亡率显著升高，已在多国暴发。然而，南美洲尤其是智利的FCV流行特征和分子机制尚属空白。

针对这一科学缺口，来自智利的研究团队在《Microbial Pathogenesis》发表了开创性研究。该团队采集2016-2019年间圣地亚哥大都会区43例患病猫的咽拭子样本，通过RT-PCR检测、基因测序和系统发育分析，结合病毒复制效率实验，首次绘制了智利FCV的分子流行病学图谱。

关键技术包括：1）基于临床症状（口腔溃疡、鼻分泌物等）的样本分层采集；2）ORF2基因靶向RT-PCR用于FCV筛查；3）5'HVR_E区氨基酸序列比对分析抗原差异；4）系统发育树构建（Genogroup I/II分型）；5）体外复制动力学实验比较VSD与URTD毒株差异。

临床特征分析
研究显示FCV阳性猫中71.4%为流浪猫，52.4%为幼猫（<1岁），口腔溃疡（61.9%）和牙龈口炎（57.1%）是最典型症状。值得注意的是，一例VSD疑似病例表现为面部水肿及多部位脱毛，但病毒复制效率与URTD毒株无显著差异，颠覆了既往认知。

分子特征解析
系统发育分析首次鉴定出智利FCV存在GI.1（主导）和GI.2两个亚群，核苷酸相似性跨度达69.45-100%。5'HVR_E区保守位点（如240-242位）的氨基酸差异，可能影响病毒受体结合能力。研究还发现，智利毒株缺乏文献报道的VSD分子标记（如297位赖氨酸），提示区域性毒株的独特进化路径。

讨论与意义
该研究揭示了智利FCV毒株的三大特征：1）疫苗逃逸株占比高（19%），呼吁更新疫苗株；2）VSD毒株未必具有复制优势，临床严重度或与宿主因素相关；3）GI亚群分化可能影响跨区域传播效率。这些发现为南美洲FCV防控提供了首个分子流行病学基线，强调开发基于本地毒株的疫苗的必要性。论文最后指出，持续监测FCV的抗原漂变（antigenic drift）对全球猫科动物健康管理具有深远意义。