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阿拉伯树胶糖苷与糖蛋白稳定纳米尿素及纳米磷酸二铵叶面相互作用的分子模拟与代谢组学分析及其对玉米生长的调控机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月20日 来源:International Journal of Biological Macromolecules 7.7
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针对传统肥料利用率低、环境负担重的问题,研究人员通过分子建模(MD)、分子对接和GC-MS代谢组学技术,揭示了阿拉伯树胶(Gum Arabic)糖苷/糖蛋白稳定纳米尿素(Nano-Urea)和纳米磷酸二铵(Nano-DAP)的叶面吸收机制,发现其通过激活玉米丝氨酸消旋酶(maize serine racemase)等靶蛋白促进代谢物(如柠檬酸、棕榈酸)表达,为精准农业提供理论依据。
在传统农业面临肥料利用率低(仅30-50%)、环境污染严重的背景下,纳米肥料因其尺寸效应(<100 nm)和精准释放特性成为研究热点。然而,纳米肥料在叶面渗透的分子机制及其对作物代谢网络的调控仍不明确。印度农民肥料合作社(IFFCO)资助的研究团队通过整合计算生物学与实验验证,首次揭示了阿拉伯树胶(Gum Arabic, GA)糖苷/糖蛋白(GP)稳定纳米尿素(Nano-Urea)的叶面吸收路径及其对玉米(Zea mays L.)代谢重编程的作用机制。
研究采用三大关键技术:1) 分子动力学模拟(MD, 100 ns)解析尿素-吐温20(Tween 20)/聚乙二醇600(PEG 600)纳米包封体系的稳定性;2) GC-MS代谢组学分析叶面施肥后玉米代谢物变化;3) 分子对接预测代谢物与玉米生长相关靶蛋白(如磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)、细胞分裂素氧化酶(CKX))的相互作用。
分子建模与分子动力学
通过100 ns MD模拟发现,GA糖苷通过氢键网络(平均键长2.8 ?)稳定纳米尿素簇,其静电势能差(ΔG=-15.2 kcal/mol)表明自发包封过程。吐温20的疏水尾链与尿素形成范德华力(4.3 kJ/mol),而PEG 600的醚氧原子与尿素-NH2形成稳定配位。
叶面相互作用机制
86 ns MD轨迹显示,纳米尿素通过破坏玉米叶蜡质层中的三十烷醇晶体结构(结合能-9.8 kcal/mol),随后与质膜磷脂酰胆碱(PC)的磷酸基团形成离子对,实现跨膜转运。
代谢组学与分子对接
GC-MS鉴定出叶面处理组柠檬酸(↑3.2倍)、邻苯二甲酸(↑1.8倍)等代谢物显著富集。对接分析表明这些代谢物与玉米丝氨酸消旋酶(PDB:5TQA)的Asp56残基形成盐桥,激活其催化活性(ΔGbind=-7.4 kcal/mol)。
该研究不仅为纳米肥料商业化生产提供分子设计依据,更开创了"计算模拟-代谢组学-靶点验证"的农业研究范式。论文发表于《International Journal of Biological Macromolecules》,其发现对实现联合国可持续发展目标(SDGs)中的零饥饿和负责任消费生产具有双重意义。
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