数据驱动的质量守恒反应扩散系统揭示p53-dsDNA共凝聚相分离的定量桥梁

【字体: 时间:2025年06月26日 来源:Structure 4.4

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  来自国内外的研究人员针对生物分子凝聚相分离机制这一前沿问题,通过构建p53蛋白与双链DNA(dsDNA)相互作用的共凝聚体系(DPIC),首次实现了质量守恒反应扩散模型(MCRD)所有参数的直接测量。该研究不仅验证了MCRD模型对相分离动力学的定量预测能力,更建立了连接理论与实验的标准化研究范式,为跨尺度生物模式形成研究提供了新工具。

  

这项突破性研究将理论建模与实验观测完美结合,如同在微观世界架起一座精准的"动力学桥梁"。科学家们选择p53肿瘤抑制蛋白与双链DNA(dsDNA)形成的共凝聚体系(DPIC)作为研究对象,这个系统妙在能直接测量质量守恒反应扩散模型(MCRD)的所有关键参数,无需参数拟合这种"猜谜游戏"。

研究发现这些生物分子凝聚体展现出浓度依赖的"智能行为"——就像微型液滴会根据周围环境自动调节大小。通过数据驱动的MCRD模型,研究者不仅成功复现了相分离过程,更预测出共凝聚体具有自相似动力学特征,这种特性让它们在不同尺度下都保持一致的"行为模式"。

该模型犹如"分子显微镜",揭示了传统方法难以捕捉的动力学细节。特别值得注意的是,所有建模参数都经过实验直接标定,避免了常见建模中参数估计带来的"误差放大"问题。这项研究为理解从亚细胞结构到生态系统的模式形成提供了普适性工具,未来或可应用于癌症相关蛋白聚集机制等医学研究领域。

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