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蓝藻Anabaena sp. PCC 7120中FUR与NtcA调控网络的互作机制及其在应激响应中的核心作用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月26日 来源:mSystems 5.0
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本研究通过电泳迁移率实验(EMSA)和转录组分析,揭示了蓝藻Anabaena sp. PCC 7120中FUR家族蛋白(FurA/FurB/FurC)与氮代谢主调控因子NtcA的协同调控网络,发现二者通过转录调控因子、双组分系统(TCS)、丝氨酸/苏氨酸激酶(STK)及σ因子(σ70家族)形成层级式应激响应通路,为理解蓝藻环境适应机制提供了新视角。
蓝藻Anabaena sp. PCC 7120通过FUR家族蛋白(FurA、FurB/Zur、FurC/PerR)和氮调控因子NtcA整合多重环境信号。FurA作为铁稳态主调控因子,直接调控1651(AraC家族)、calB(AbrB家族)等转录因子,并通过双组分系统all7584-83(类copS/copR同源体)影响铜代谢。FurB(Zur)特异性结合锌响应元件,控制smtB等靶点,而FurC(PerR)通过调控alr1976(XRE家族)参与氧化应激响应。值得注意的是,三者共同调控核心σ因子(如sigA、sigD),形成环境适应的第一道防线。
NtcA与FUR家族的协同作用尤为突出。16个调控基因(如cyaC腺苷酸环化酶、pknE激酶)同时受FUR和NtcA直接调控。例如,pknE在氮饥饿时表达上调,其启动子区同时存在FurA-box和NtcA结合位点(GTAN8TAC)。这种交叉调控将铁/锌可利用性与氮信号耦合,解释了异形胞分化过程中金属依赖的氮酶活性调控机制。
12个σ因子(σ70家族)全部受至少一种FUR蛋白调控。sigC、sigE、sigG等氮响应因子被FurA和NtcA共同控制,而耐盐相关的sigB2受FurC特异性调控。有趣的是,sigA(管家基因σ因子)的启动子被FUR家族所有成员及NtcA结合,暗示基础转录机器对环境信号的广泛敏感性。
EMSA揭示调控蛋白结合位点的空间竞争。例如,all7584-83启动子中FurA与FurB结合域重叠,而pkn22的FurA-box直接覆盖转录起始位点(TSS),导致其表达抑制。此外,双组分系统rpaA(生物钟输出元件)受FurA激活和NtcA抑制,将昼夜节律与氮/铁信号联系起来。
该网络解释了蓝藻应对氮缺乏的多层次策略:FUR蛋白通过调控次级效应器(如激酶pknD、腺苷酸环化酶cyaB2)放大初始信号,而σ因子的级联反应则重编程全基因组转录。与单细胞蓝藻Synechocystis相比,Anabaena的调控网络更复杂,可能与其多细胞分化能力相关。研究为工程化蓝藻的胁迫耐受性提供了精准靶点。
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