Solidesulfovibrio sp. DCME全基因组测序揭示厌氧二氯甲烷降解微生物群落的关键氢循环机制

来自加拿大的研究人员针对二氯甲烷（DCM）污染修复难题，通过宏基因组测序技术解析了厌氧降解菌群DCME中关键菌株Solidesulfovibrio sp. DCME的闭合基因组。该菌株携带7种氢化酶基因（包括Ech型、Hyn型等），其氢循环功能为维持低氢分压促进DCM矿化提供关键 syntrophic 支持，为污染场地生物修复提供新靶点。

　　

科研团队从加州污染地下水分离的厌氧微生物群落DCME中，成功组装出Solidesulfovibrio sp. DCME的完整基因组（5.39 Mb，GC含量65.7%）。该菌株通过复杂的氢代谢网络——编码7种氢化酶（hydrogenases）包括能量耦合型Ech、周质摄取型Hyn_NiFe及电子分岔型Hnd_FeFe等——动态调控氢分压，驱动二氯甲烷（DCM）的完全矿化。系统发育分析显示其属于Solidesulfovibrio属新分支，基因组注释发现4,697个编码基因和完整核糖体操纵子。研究采用PacBio长读长（N₅₀=65,981 bp）与Illumina短读长混合组装策略，经Canu优化参数和Polypolish校正，最终获得高完整度（97.78%）的环状基因组。该发现为理解污染环境微生物组的功能互作提供了分子基础。