蜜蜂卵黄原蛋白天然结构的冷冻电镜解析揭示其多功能分子机制

【字体: 时间:2025年07月02日 来源:Nature Communications 14.7

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  本研究通过冷冻电镜技术首次解析了蜜蜂(Apis mellifera)卵黄原蛋白(Vg)的3.2?全结构,揭示了其脂质结合腔、von Willebrand因子D结构域(vWD)和C端胱氨酸结结构域(CTCK)的分子特征。研究团队从血淋巴中一步纯化获得Vg,发现其具有锌离子结合位点、糖基化修饰和150 kDa的天然剪切产物,为理解Vg在免疫、抗氧化和社会行为中的多效性(pleiotropy)提供了结构基础。该成果发表于《Nature Communications》,对LLTP(大脂质转运蛋白)超家族的功能进化研究具有重要启示。

  

在自然界中,卵黄原蛋白(Vitellogenin, Vg)堪称"分子瑞士军刀"——这种存在于几乎所有卵生动物中的脂糖金属磷蛋白,不仅是卵黄的主要前体,还意外地承担着免疫防御、抗氧化、社会行为调控等多项任务。蜜蜂社会中,工蜂的寿命分化、阶级分工甚至群体免疫力,都与Vg的神秘功能密切相关。然而,这种"一专多能"的分子机制始终笼罩在迷雾中,尤其缺乏非脊椎动物Vg的高分辨率结构信息。

挪威卑尔根大学、德国明斯特大学等机构的研究团队在《Nature Communications》发表突破性成果,首次通过冷冻电镜解析了蜜蜂Vg(AmVg)的天然结构。研究人员从蜜蜂血淋巴中直接纯化出AmVg,不仅获得了3.2?的全长蛋白结构,还意外捕获到150 kDa的天然剪切产物(3.0?)。这项研究揭示了Vg家族中保守的脂质结合模块、首次报道的vWD结构域空间构象,并鉴定出CTCK结构域可能介导的二聚化机制。

研究团队运用冷冻电镜单颗粒分析技术,从23,127张显微图像中重构出AmVg及其剪切产物的高分辨率结构。通过多序列比对验证结构元件的进化保守性,并利用AlphaFold预测辅助模型构建。样本来源于天然冬眠蜜蜂(Apis mellifera carnia)血淋巴,采用离子交换色谱纯化,未添加金属螯合剂以保留天然锌结合状态。

主要研究结果

天然AmVg的整体结构
全长AmVg呈现典型的LLTP超家族特征:N端β片层(N-sheet)构成受体结合域,A/C片层形成33,506?3的脂质结合腔,17个α螺旋组成的螺旋域包裹其外。特别值得注意的是,在C端首次观察到vWD结构域通过柔性连接肽(1411-1432)锚定在脂质腔开口处,其β三明治结构通过三对二硫键(C1444-C1598等)稳定,与人类vWF结构相似但缺乏二聚化所需的半胱氨酸。

结构多态性与翻译后修饰
在脂质腔边缘发现未建模的磷脂密度(图3a-c),N296位点鉴定出高甘露糖型糖基化(图3d)。螺旋域表面密集分布34个正电荷残基(图3e),解释了Vg的膜结合能力。三个潜在锌结合位点中,位点2(H587-H593)在昆虫特异性loop中保守性最高(图5),其不完整的配位 sphere 暗示低亲和力结合,可能适应卵细胞对锌的动态需求。

150 kDa剪切产物的结构启示
该产物缺失vWD和部分A片层,但保留完整脂质腔(图6)。剪切可能发生在R/KXXR/K蛋白酶识别基序(如1274RYGK),其暴露的脂质腔提示该片段可能专职脂质转运。与银鳗(Ichthyomyzon unicuspis)Lv结构比较显示,剪切导致二硫键(C1242-C1279)丢失,使β链构象更松弛。

AlphaFold预测的验证与局限
AlphaFold2预测的AmVg模型与实验结构主链RMSD仅2.21?,准确预测了vWD域的空间排布。但AI模型未能反映糖基化、金属结合和剪切变异,最新AlphaFold3虽能预测钙锌结合位点(pLDDT 65.15-78.24),仍无法替代实验结构。

结论与展望
这项研究破解了蜜蜂Vg的"结构密码":vWD和CTCK结构域的发现为理解LLTP超家族的进化提供了新视角;不完整的锌配位模式解释了Vg的金属缓冲能力;剪切产物的结构启示了Vg功能分化的可能途径。特别值得注意的是,与人类vWF不同,AmVg的vWD缺乏二聚化半胱氨酸,但CTCK可能通过非共价作用介导同源结合——这种变异或反映昆虫Vg在免疫与生殖功能间的平衡。

研究还留下待解之谜:多聚丝氨酸区(polyS, 340-384)的磷酸化修饰如何动态调控?剪切产物是否参与跨代免疫?这些发现不仅为蜜蜂健康养殖提供分子靶点,更启示了从结构多态性角度理解蛋白质多效性的新范式。正如作者指出,Vg的分子复杂性正是其"一专多能"的进化根基,这种特性在LLTP超家族中可能普遍存在。

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