中国沈阳细河沉积物中脱卤球菌J1和嗜三氯杆菌J2菌株的基因组草图解析及其在四氯乙烯厌氧降解中的作用

来自中国的研究人员针对氯代溶剂污染场地修复难题，从沈阳细河沉积物中分离出具有完全脱氯能力的厌氧菌群，通过宏基因组组装获得脱卤球菌(Dehalococcoides mccartyi)J1和嗜三氯杆菌(Trichlorobacter lovleyi)J2的基因组草图（大小分别为1.37Mb和3.84Mb），鉴定出12个和2个还原脱卤酶(RDase)基因，揭示了这两种关键有机卤呼吸菌(OHRB)将四氯乙烯(PCE)逐步还原为乙烯的分子机制，为生物修复提供了重要菌种资源。

　　

在辽宁沈阳细河(41.6628°N, 123.1055°E)的淡水沉积物中，科学家们发现了一个神奇的微生物联盟——它们能将有毒的四氯乙烯(PCE)像拆解乐高积木一样，逐步还原成无害的乙烯。通过建立含0.5mM PCE、H₂/CO₂氛围的厌氧微宇宙，这个菌群展示了完美的"脱氯四部曲"：PCE→三氯乙烯→二氯乙烯→氯乙烯→乙烯，整个过程被气相色谱(GC-FID)实时捕捉。

宏基因组测序揭开了幕后功臣的面纱：脱卤球菌J1有着精简的1.37Mb基因组却藏着12把"分子剪刀"——还原脱卤酶(RDase)，其中一把剪刀TceA与已知酶有99.6%相似度；而体型更大的嗜三氯杆菌J2(3.84Mb)则携带两把专门剪断PCE的"剪刀"PceA。这些发现如同找到了环境修复的"微生物工具箱"，58.3×和72.6×的基因组覆盖度确保了我们看清每个工具细节。

值得注意的是，J1菌株与CG4菌株就像"表兄弟"(ANI 97.8%)，而J2菌株则与SZ菌株堪称"双胞胎"(ANI 97.9%)。它们的基因组质量堪称教科书级别——完整性＞99%，污染率＜1.3%，连挑剔的CheckM软件都给出满分。这些藏在河泥里的"清洁工"，正等待着在氯污染场地上大展身手呢！

（注：基因组数据已存入GenBank，编号JBNLRZ000000000和JBNLSA000000000）