基于质体DNA条形码(matK/atpB)的计算机模拟验证:解决鳞毛蕨属(Dryopteris)物种复合体分类难题

【字体: 时间:2025年07月09日 来源:Genetic Resources and Crop Evolution 1.6

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  为解决鳞毛蕨属(Dryopteris)形态分类难以区分近缘种的问题,研究人员通过计算机模拟验证了4种质体DNA条形码(rbcL/matK/psbA/atpB)的鉴别效力。研究发现matK和atpB位点核苷酸变异率高,成功区分12个物种,而psbA和rbcL分辨力不足。该研究为蕨类植物系统发育和物种鉴定提供了分子标记选择依据。

  

传统形态学分类在区分鳞毛蕨属(Dryopteris)物种时面临挑战,尤其难以解决近缘种复合体的分类难题。这项研究另辟蹊径,采用计算机模拟手段验证了四种叶绿体DNA条形码标记——包括编码基因rbcL、matK、psbA和atpB——在12种鳞毛蕨中的鉴别效力。

通过生物信息学分析发现,matK和atpB这两个位点展现出惊人的核苷酸多态性,犹如给每个物种贴上了独特的分子身份证。相比之下,psbA和rbcL则像模糊的老照片,难以清晰区分不同物种。研究人员还构建了最大似然法(maximum-likelihood)系统发育树,matK和atpB联用就像高精度显微镜,成功解析了包括D. championii、D. crassirhizoma等14个物种(注:原文列举14个种名但前文称12个物种,此处保留原文数据)的演化关系。

这项研究不仅为蕨类植物鉴定提供了"黄金标准"般的分子标记组合(matK+atpB),更揭示了质体基因组在解决蕨类植物分类难题中的巨大潜力。这些发现就像为植物分类学家配备了一把分子尺,将显著提升鳞毛蕨科(Dryopteridaceae)物种鉴定和系统发育研究的准确性。

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