非洲HIV阳性弥漫性大B细胞淋巴瘤的共享基因组特征:马拉维与南非队列研究

【字体: 时间:2025年07月10日 来源:Scientific Reports 3.8

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  这篇研究通过全外显子测序分析了非洲两个队列(马拉维和南非)中48例HIV阳性(HIV+)弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的基因组特征,揭示了抗逆转录病毒治疗(ART)对肿瘤突变谱的影响,并发现ANKRD11突变与预后相关。研究首次报道了非洲HIV+ DLBCL中高频共享突变(如MYD88 p.S206C)和微卫星不稳定性(MSI)表型,为这一 underserved 人群的精准治疗提供了潜在靶点。

  

引言背景

非洲HIV感染者(PWH)中弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)是主要死因,但相关基因组研究严重不足。随着抗逆转录病毒治疗(ART)普及,HIV+DLBCL生物学特性可能发生改变。本研究整合马拉维(MW)和南非(SA)两个非洲队列,通过全外显子测序探索HIV和ART对DLBCL突变谱的影响。

研究方法

48例DLBCL肿瘤(40例HIV+)及其配对胚系样本接受全外显子测序(Agilent SureSelect平台)。使用jUNCtion流程进行变异检测,MAFtools分析突变特征。通过Kraken分类EBV状态,MANTIS预测微卫星不稳定性(MSI),LymphGen工具进行分子分型。

关键发现

临床差异:SA患者生存更差(HR=0.37, p=0.008),与更高LDH(中位数966 vs. 453, p=0.001)和晚期分期相关。HIV+/ART-na?ve患者CD4更低(p=0.05),但MW队列中其生存反而优于HIV-患者(HR=0.58, p=0.043)。

突变特征

  • ART暴露差异:HIV+/ART-na?ve富集DNA损伤相关基因(BOD1L1/EML4),而HIV+/ART-exp富集DUSP2/PIM1(FDR<0.05)。
  • 跨队列共享突变:MYD88 p.S206C仅见于HIV+/ART-exp肿瘤,可能成为治疗靶点。
  • 预后标志:ANKRD11突变患者生存更优(HR=3.34, p=0.054),且与高TMB相关(4.8倍,p=0.0087)。

MSI表型:8例MSI-high肿瘤中,2例(MW20/SA07)同时携带PMS2(p.T89P/p.L239P)和ARID1A(p.Y948H/p.Y1226H)突变,呈现超突变特征(TMB>5倍中位数)。

讨论意义

研究首次揭示非洲HIV+DLBCL存在独特分子亚型:

  1. ART相关突变谱差异提示治疗史影响淋巴瘤发生机制;
  2. MYD88 p.S206C等共享变异可作为区域特异性生物标志物;
  3. MSI-high伴PMS2/ARID1A突变患者或受益于PARP抑制剂等DNA损伤靶向治疗。

局限与展望

样本量较小且来自特定医疗中心,需扩大队列验证。未来应探索EBV-肿瘤中KMT2D突变的功能意义,以及ANKRD11在免疫调控中的作用。该研究为资源有限地区HIV相关淋巴瘤的精准诊疗奠定了基础。

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