巴西南部苹果与梨树病毒及类病毒分子特征与流行病学调查

来自巴西的研究人员针对南部圣卡塔琳娜州(SC)和南里奥格兰德州(RS)苹果梨树衰退问题，通过高通量测序(HTS)和RT-PCR技术首次在SC检出柑橘凹胶相关病毒(CCGaV)，并全球首次在梨树中发现苹果锤头类病毒(AHVd)。研究发现23份样本存在苹果茎沟病毒(ASPV)与苹果茎痘病毒(ASGV)共感染，18份样本携带≥3种病原体，为果园病毒防控提供重要依据。

　　

在巴西经济中占据重要地位的苹果梨种植业，正遭受病毒(viruses)和类病毒(viroids)的严重威胁。这项针对SC州拉热斯、弗赖布戈、圣若阿金、帕伊内尔及RS州瓦卡里亚果园的研究，从53份样本中提取总RNA进行病原筛查。高通量测序(HTS)在14份样本中捕获到柑橘凹胶相关病毒(CCGaV)和苹果锤头类病毒(AHVd)的踪迹——后者更是首次在梨树上被"逮个正着"。

通过构建包含全球数据的系统发育树，研究者用RT-PCR对全部样本展开"精准围剿"，检测苹果茎痘病毒(ASPV)、苹果茎沟病毒(ASGV)、苹果花叶病毒(ApMV)、苹果褪绿叶斑病毒(ACLSV)等目标病原。结果令人警醒：CCGaV在16份样本中"安营扎寨"，其中13份来自SC州；ASPV与ASGV这对"病毒搭档"在23份样本中"狼狈为奸"；更有18份样本遭遇≥3种病原体的"组团侵袭"。这项研究不仅绘制出南巴西果园病原体的"犯罪地图"，更为全球果树病毒防控提供了新的"通缉名单"。