发酵床垫料中分离的新型黄色副土地杆菌(Parapedobacter flavus sp. nov.)的鉴定与分类学研究

研究人员从发酵床垫料中分离获得一株革兰氏阴性需氧杆菌4-7-4T，通过16S rRNA基因分析确定其属于副土地杆菌属(Parapedobacter)，与P. soli KCTC 12984T相似度达96.03%。基因组分析显示平均核苷酸相似性(ANI)为78.6%，数字DNA-DNA杂交(dDDH)为21.6%，证实为新种。该菌主要含磷脂酰乙醇胺(PE)、甲基萘醌-7(MK-7)及特征性脂肪酸，基因组大小4.89Mb，GC含量49.8%，被命名为Parapedobacter flavus sp. nov.，为微生物资源库增添新成员。

　　

科研团队从发酵床垫料中成功分离出一株编号为4-7-4^T的革兰氏阴性需氧杆菌。通过16S核糖体RNA(16S rRNA)基因测序分析，发现这株细菌在进化树上与副土地杆菌属(Parapedobacter)成员亲缘关系最近，与已知最近缘种P. soli KCTC 12984^T的相似度为96.03%。进一步的基因组比对显示，两者间的平均核苷酸相似性(ANI)仅为78.6%，数字DNA-DNA杂交(dDDH)值为21.6%，均低于界定新物种的阈值标准。

这株细菌的细胞膜主要含有磷脂酰乙醇胺(PE)、一种未鉴定的氨基脂质和四种未知脂类。呼吸链中的主要醌类成分是甲基萘醌-7(MK-7)。细胞脂肪酸组成分析显示，特征性组分3(包含C_16:1 ω7c和/或C_16:1 ω6c)和异-C_15:0占主导地位。全基因组测序表明其基因组大小为4,890,729碱基对，DNA的鸟嘌呤加胞嘧啶(GC)含量为49.8%。

基于上述多相分类学研究结果，科研人员正式将该菌株鉴定为副土地杆菌属的新物种，并赋予其拉丁学名Parapedobacter flavus sp. nov.。该菌的模式菌株4-7-4^T已保藏于中国普通微生物菌种保藏管理中心(CGMCC 1.10938^T)和韩国典型菌种保藏中心(KCTC 92351^T)，为微生物多样性研究提供了新的重要资源。