椰枣(Phoenix dactylifera L.)基因组微卫星标记开发及其在棕榈科遗传多样性与跨属转移性研究中的应用

【字体: 时间:2025年07月16日 来源:Sugar Tech 1.8

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  为解决椰枣分子标记资源匮乏问题,研究人员通过全基因组扫描开发了215,013个SSR标记,验证了71个高多态性标记(HPP),在48个基因型中鉴定出22个多态性标记(PIC最高达0.67),并证实其在棕榈科10个物种中具有跨属转移性(最高80.33%),为棕榈科作物的遗传育种提供了重要工具。

  

在干旱半干旱地区具有重要经济价值的椰枣(Phoenix dactylifera L.),其分子标记开发一直存在空白。这项突破性研究通过全基因组扫描,首次系统鉴定了215,013个完美型微卫星(SSR)位点,其中二核苷酸重复(DNR)和单核苷酸重复(MNR)各占37.94%和37.84%。研究人员设计的169,200对引物中,71个高多态潜力(HPP)标记在测试中展现出87.04%的扩增成功率。

令人振奋的是,使用22个多态性标记对48个椰枣基因型的分析,不仅揭示了丰富的等位基因变异,还通过群体结构分析发现两大遗传簇(K=2),暗示着不同的起源背景。特别值得注意的是,十个标记的多态信息含量(PIC)突破0.5大关,最高达0.67,展现出极强的遗传解析能力。

更引人注目的是这些标记在棕榈科的跨属"旅行"能力:在槟榔(areca nut)中转移率高达80.33%,而在棕榈(areca palm)中仅9.84%,六种植物超过50%的转移率为比较基因组学研究打开新窗口。这些"分子身份证"的诞生,为棕榈科作物的种质保护、遗传图谱构建和标记辅助育种(MAB)提供了强大工具。

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