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胎盘蛋白与靶蛋白互作机制的计算与实验研究:骨关节炎治疗新策略
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月21日 来源:Current Protein & Peptide Science 1.9
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本研究针对骨关节炎(OA)治疗难题,通过蛋白-蛋白对接(protein-protein docking)和分子动力学(MD)模拟,系统分析了胎盘蛋白与蛋白酶及OA靶蛋白的相互作用。研究发现胎盘蛋白具有优异的结合能力(对接评分-1700至-2450.3),MD模拟证实复合物稳定性,流式细胞术验证其抗炎活性,为开发新型OA生物制剂提供了理论依据。
这项创新性研究聚焦骨关节炎(OA)这一慢性关节疾病,其典型特征是关节软骨的进行性软化和降解。科研团队采用多学科交叉方法,首先通过NCBI保守结构域数据库预测功能蛋白域,结合MEME套件和My-Hits数据库识别蛋白序列基序。利用Expasy-ProtParam在线工具分析蛋白物理参数后,研究团队运用ClusPro高级选项对选定胎盘蛋白与特定OA靶蛋白进行精准对接,结合PDBsum和Biovia Discovery Studio实现分子互作可视化。
研究亮点在于采用100纳秒(ns)分子动力学(MD)模拟,通过DESMOND软件验证复合物稳定性。结果显示:胎盘蛋白与蛋白酶互作对接评分达-1700至-2450.3,与特定靶蛋白互作评分为-900至-1400。PDBsum分析揭示了关键残基互作、氢键和非键接触。流式细胞术实验进一步证实人胎盘组织对脂多糖诱导巨噬细胞的抗炎活性。
这些发现为开发新型OA治疗策略提供了重要依据,特别是胎盘来源的生物制剂可能成为传统膝关节置换术的替代方案。研究采用的计算机辅助药物设计(CADD)与湿实验验证相结合的模式,为后续转化医学研究奠定了坚实基础。
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