综述:Sumner的遗产:脲酶结晶百年及最新结构研究进展

【字体: 时间:2025年07月21日 来源:Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology 6.2

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  这篇综述系统回顾了脲酶(urease)研究的百年历程,从1926年James B. Sumner首次获得脲酶晶体(首个结晶酶)的里程碑事件,到发现其作为首个镍(Ni)依赖酶(Zerner团队)的突破性进展。文章深入探讨了脲酶活性中心结构、催化机制(enzyme mechanism)及生物合成途径(biosynthetic pathway)的研究进展,并对该领域未解问题提出前瞻性思考。

  

Abstract
1926年,James B. Sumner成功结晶了刀豆脲酶(jack bean urease),这是人类历史上首个获得晶体结构的酶,由此证实了酶的蛋白质本质。在纪念这一重大事件100周年之际,本文梳理了Sumner研究的关键背景,阐释了其发现的科学意义,并系统总结了后续关于脲酶的重要研究成果。

百年探索:从酶本质到金属活性中心
Sumner的突破性工作不仅证明了酶的蛋白质属性,更为结构生物学研究奠定了基础。约50年后,Burt Zerner团队意外发现脲酶是首个含镍(Ni)的金属酶(metalloenzyme),这一发现彻底改变了人们对酶催化中心的认识。镍离子的存在引发了三个核心科学问题:含金属活性位点(metal-containing active site)的精确结构、酶催化反应的分子机制,以及镍中心如何被组装到蛋白质中。

结构生物学解密:镍中心的奥秘
通过X射线晶体学(X-ray crystallography)等技术,研究者揭示了脲酶活性中心的双核镍结构(binuclear Ni site),其中两个镍离子通过羧酸桥联(carboxylate bridge)协同作用。镍离子与组氨酸(His)残基的配位模式,以及脲素底物在活性中心的结合构象,为理解其水解机制提供了结构基础。

催化机制:从静态结构到动态过程
研究表明,脲酶通过镍离子激活水分子产生亲核氢氧根(OH-),进而攻击脲素的羰基碳(carbonyl carbon)。关键中间态结构的捕获证实了硫醇盐(thiolate)辅助的质子转移过程,而同位素标记实验则揭示了反应过程中氧原子的去向。

生物合成:镍中心的组装之谜
脲酶成熟需要专门的辅助蛋白(accessory proteins)将镍离子递送至活性中心。研究发现UreD/UreF/UreG等分子伴侣(chaperones)形成多组分系统,通过ATP依赖(ATP-dependent)的过程完成镍离子的精准定位。这一过程还涉及独特的金属载体(metallochaperone)和GTP水解(GTP hydrolysis)机制。

未来展望:未解问题与技术前沿
尽管取得重大进展,脲酶研究仍存在诸多挑战:镍中心组装的时空调控机制、酶活性与金属稳态(metal homeostasis)的关联、以及脲酶在病原微生物(如幽门螺杆菌)中的致病机理等。新兴技术如冷冻电镜(cryo-EM)和时间分辨晶体学(time-resolved crystallography)可能为这些问题的解决提供新视角。

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