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印度东部高原与山区地带葫芦科作物尖角瓜(Trichosanthes dioica)的遗传多样性解析:形态学与分子标记的协同揭示
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月22日 来源:Journal of Genetic Engineering and Biotechnology 3.6
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为解决尖角瓜(Trichosanthes dioica)遗传多样性研究不足的问题,印度研究人员通过整合形态学性状与ISSR分子标记,对46份基因型进行多维度分析。研究发现,主成分分析(PCA)揭示72.53%的形态变异由果实重量(0.47)、果肉重量(0.46)等驱动,而ISSR标记显示78.91%的多态性,PIC值达0.35-0.47。Swarna Rekha等基因型被鉴定为高多样性资源,为育种提供了重要遗传基础。该研究为开发高产、营养丰富的尖角瓜品种奠定了科学依据。
尖角瓜(Trichosanthes dioica)作为印度本土的雌雄异株葫芦科作物,因其高营养价值被誉为"瓜中之王",但其遗传多样性长期缺乏系统研究,制约了育种进展。传统繁殖方式依赖无性繁殖,导致基因重组受限,而种子繁殖又面临发芽率低、性别鉴定困难等问题。这些瓶颈使得尖角瓜的产量和品质提升遭遇挑战。为此,印度农业研究委员会东部区域研究中心(ICAR-Research Complex for Eastern Region)的科研团队开展了开创性研究,通过整合形态学与分子生物学手段,首次全面解析了印度东部高原与山区46份尖角瓜基因型的遗传多样性,相关成果发表在《Journal of Genetic Engineering and Biotechnology》。
研究采用形态学定量分析结合ISSR(Inter-Simple Sequence Repeat)分子标记技术。在形态学层面,对12个农艺性状(如果实重量、果肉重量、果实体积等)进行测量,运用主成分分析(PCA)和聚类分析;分子层面使用16个多态性ISSR引物扩增DNA片段,通过STRUCTURE软件进行群体遗传结构分析。样本来源于印度东部四邦(北方邦、比哈尔邦、奥里萨邦和西孟加拉邦)的地方品种及改良品种。
3.1. Per Se performance of morphological traits
研究发现尖角瓜基因型间存在显著表型变异。总产量变幅4.07-23.73 t/ha,Swarna Alaukik以23.73 t/ha居首;单株果数11-151个,Swarna Alaukik达151个;果实重量15.75-49.01 g,Swarna Rekha最重。主成分分析显示,PC1(33.3%变异)主要由果实重量(0.47)、果肉重量(0.46)贡献,PC2(24.5%)与产量(0.53)、果数(0.49)相关。
3.2. Genetic parameter
遗传参数分析表明,单株果数的遗传变异系数(GCV)和表型变异系数(PCV)最高(46.10%和47.07%),广义遗传力达95.92%。产量相关性状兼具高遗传力(92.83%)和高遗传进度(73.04%),表明其受加性基因效应主导。
3.6. Polymorphism statistics and diversity indices of ISSR markers
分子标记分析显示,16个ISSR引物共产生96条带,多态性78.91%,PIC值0.35-0.47。UBC857引物多态性最高(PIC=0.47),而UBC868的Shannon指数(I)达0.67,反映高多态性。
3.9. Population structure analysis
STRUCTURE分析将基因型分为3个亚群(K=3),AMOVA显示95%变异存在于群体内部。SP2亚群遗传分化最高(Fst=0.3306),包含HAP-96等13个基因型;SP1(含Swarna Suruchi等)基因流最活跃(Fst=0.0225)。
这项研究首次系统整合形态与分子数据揭示尖角瓜遗传多样性,发现Swarna Rekha、HAP-24等基因型具有独特遗传背景。通过建立性状-标记关联,为分子标记辅助选择提供了依据。尤其重要的是,研究证实尽管尖角瓜以无性繁殖为主,但仍保持较高遗传多样性,这主要归因于农民对地方品种的长期驯化选择。该成果不仅填补了尖角瓜遗传资源研究的空白,其采用的"形态-分子"双轨鉴定策略更为其他无性繁殖作物多样性研究提供了范式。未来利用这些高多样性基因型进行杂交育种,有望培育出突破性新品种,对保障印度及热带地区的粮食安全具有重要意义。
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