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南卡罗来纳州Hanahan地区B13亚簇分枝杆菌噬菌体Hashim76全基因组测序及治疗潜力解析
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月22日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.7
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来自南卡罗来纳州的研究团队针对分枝杆菌感染治疗难题,完成了B13亚簇噬菌体Hashim76的全基因组测序。该噬菌体分离自当地池塘淤泥,具有70,230 bp环状双链DNA(GC含量70.1%)和101个预测蛋白编码基因,与Zenteno07基因组相似度达93.91%。研究通过Illumina MiSeq测序和电镜技术证实其Siphovirus形态特征,为噬菌体疗法(phage therapy)提供了新型候选株。
在对抗分枝杆菌感染的科研战场上,一株代号Hashim76的噬菌体新兵从南卡罗来纳州Hanahan的池塘淤泥中脱颖而出。这株属于B13亚簇的噬菌体战士,展现出典型的Siphovirus形态——73.5纳米直径的二十面体衣壳搭配309.9纳米长的柔性尾巴,专精于侵染Mycobacterium smegmatis mc2155宿主菌。
科研团队采用Illumina MiSeq测序平台,像拼图大师般将47万条测序读长组装成70,230 bp的环状基因组拼图。这个富含GC(70.1%)的DNA蓝图藏着101个蛋白编码基因,其中31个已破解功能,更有5个基因是B13亚簇成员共有的"身份徽章"。有趣的是,基因组里竟找不到任何tRNA的踪迹。
通过电子显微镜的"火眼金睛",可见Hashim76与得克萨斯州的Zenteno07堪称孪生兄弟(93.91%基因组相似性),但与南非BirdsNest噬菌体稍显疏远。其独特的gp66、gp84等基因或将成为未来对抗结核分枝杆菌的"基因武器库"。
这项研究得到霍华德·休斯医学研究所(HHMI)支持,测序数据已存入GenBank(PQ844485),为全球噬菌体疗法研究添砖加瓦。
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